Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB8

PPCS, Phosphopantothenate--cysteine ligase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPCSQ9HAB8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPCSQ9HAB8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPCSQ9HAB8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPCSQ9HAB8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPCSQ9HAB8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPCSQ9HAB8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPCSQ9HAB8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPCSQ9HAB8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPCSQ9HAB8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPCSQ9HAB8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPCSQ9HAB8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPCSQ9HAB8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPCSQ9HAB8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPCSQ9HAB8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPCSQ9HAB8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPCSQ9HAB8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPCSQ9HAB8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPCSQ9HAB8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPCSQ9HAB8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPCSQ9HAB8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPCSQ9HAB8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPCSQ9HAB8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPCSQ9HAB8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
PPCSQ9HAB8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PPCSQ9HAB8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPCSQ9HAB8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPCSQ9HAB8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPCSQ9HAB8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPCSQ9HAB8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPCSQ9HAB8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPCSQ9HAB8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPCSQ9HAB8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPCSQ9HAB8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPCSQ9HAB8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPCSQ9HAB8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PPCSQ9HAB8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPCSQ9HAB8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPCSQ9HAB8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPCSQ9HAB8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPCSQ9HAB8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPCSQ9HAB8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPCSQ9HAB8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPCSQ9HAB8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPCSQ9HAB8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPCSQ9HAB8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPCSQ9HAB8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPCSQ9HAB8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPCSQ9HAB8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPCSQ9HAB8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPCSQ9HAB8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPCSQ9HAB8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPCSQ9HAB8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPCSQ9HAB8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPCSQ9HAB8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPCSQ9HAB8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPCSQ9HAB8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPCSQ9HAB8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPCSQ9HAB8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPCSQ9HAB8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPCSQ9HAB8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPCSQ9HAB8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPCSQ9HAB8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPCSQ9HAB8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPCSQ9HAB8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPCSQ9HAB8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPCSQ9HAB8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPCSQ9HAB8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPCSQ9HAB8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPCSQ9HAB8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPCSQ9HAB8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PPCSQ9HAB8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPCSQ9HAB8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPCSQ9HAB8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPCSQ9HAB8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPCSQ9HAB8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPCSQ9HAB8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPCSQ9HAB8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PPCSQ9HAB8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPCSQ9HAB8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPCSQ9HAB8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPCSQ9HAB8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPCSQ9HAB8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PPCSQ9HAB8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPCSQ9HAB8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPCSQ9HAB8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPCSQ9HAB8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPCSQ9HAB8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPCSQ9HAB8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPCSQ9HAB8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPCSQ9HAB8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPCSQ9HAB8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPCSQ9HAB8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PPCSQ9HAB8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPCSQ9HAB8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPCSQ9HAB8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPCSQ9HAB8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPCSQ9HAB8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPCSQ9HAB8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPCSQ9HAB8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPCSQ9HAB8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms