Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BCAS3Q9H6U6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BCAS3Q9H6U6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BCAS3Q9H6U6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BCAS3Q9H6U6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BCAS3Q9H6U6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BCAS3Q9H6U6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BCAS3Q9H6U6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BCAS3Q9H6U6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BCAS3Q9H6U6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BCAS3Q9H6U6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BCAS3Q9H6U6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
BCAS3Q9H6U6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BCAS3Q9H6U6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BCAS3Q9H6U6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
BCAS3Q9H6U6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BCAS3Q9H6U6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BCAS3Q9H6U6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
BCAS3Q9H6U6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BCAS3Q9H6U6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BCAS3Q9H6U6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
BCAS3Q9H6U6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BCAS3Q9H6U6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BCAS3Q9H6U6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BCAS3Q9H6U6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
BCAS3Q9H6U6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BCAS3Q9H6U6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BCAS3Q9H6U6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BCAS3Q9H6U6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BCAS3Q9H6U6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BCAS3Q9H6U6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BCAS3Q9H6U6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BCAS3Q9H6U6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BCAS3Q9H6U6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BCAS3Q9H6U6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BCAS3Q9H6U6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
BCAS3Q9H6U6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
BCAS3Q9H6U6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
BCAS3Q9H6U6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
BCAS3Q9H6U6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
BCAS3Q9H6U6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BCAS3Q9H6U6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BCAS3Q9H6U6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BCAS3Q9H6U6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BCAS3Q9H6U6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BCAS3Q9H6U6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BCAS3Q9H6U6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BCAS3Q9H6U6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BCAS3Q9H6U6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BCAS3Q9H6U6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BCAS3Q9H6U6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BCAS3Q9H6U6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BCAS3Q9H6U6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BCAS3Q9H6U6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
BCAS3Q9H6U6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BCAS3Q9H6U6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BCAS3Q9H6U6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BCAS3Q9H6U6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BCAS3Q9H6U6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BCAS3Q9H6U6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BCAS3Q9H6U6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BCAS3Q9H6U6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BCAS3Q9H6U6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BCAS3Q9H6U6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BCAS3Q9H6U6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BCAS3Q9H6U6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BCAS3Q9H6U6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BCAS3Q9H6U6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BCAS3Q9H6U6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BCAS3Q9H6U6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BCAS3Q9H6U6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BCAS3Q9H6U6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BCAS3Q9H6U6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BCAS3Q9H6U6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
BCAS3Q9H6U6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BCAS3Q9H6U6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BCAS3Q9H6U6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
BCAS3Q9H6U6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
BCAS3Q9H6U6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
BCAS3Q9H6U6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
BCAS3Q9H6U6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BCAS3Q9H6U6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BCAS3Q9H6U6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BCAS3Q9H6U6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BCAS3Q9H6U6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BCAS3Q9H6U6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BCAS3Q9H6U6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BCAS3Q9H6U6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BCAS3Q9H6U6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BCAS3Q9H6U6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BCAS3Q9H6U6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BCAS3Q9H6U6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
BCAS3Q9H6U6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BCAS3Q9H6U6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BCAS3Q9H6U6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BCAS3Q9H6U6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BCAS3Q9H6U6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BCAS3Q9H6U6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BCAS3Q9H6U6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BCAS3Q9H6U6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms