Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6T3

RPAP3, RNA polymerase II-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP3Q9H6T3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPAP3Q9H6T3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPAP3Q9H6T3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPAP3Q9H6T3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RPAP3Q9H6T3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RPAP3Q9H6T3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
RPAP3Q9H6T3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RPAP3Q9H6T3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RPAP3Q9H6T3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RPAP3Q9H6T3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
RPAP3Q9H6T3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RPAP3Q9H6T3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RPAP3Q9H6T3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RPAP3Q9H6T3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RPAP3Q9H6T3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RPAP3Q9H6T3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RPAP3Q9H6T3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RPAP3Q9H6T3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPAP3Q9H6T3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPAP3Q9H6T3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPAP3Q9H6T3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPAP3Q9H6T3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPAP3Q9H6T3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPAP3Q9H6T3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RPAP3Q9H6T3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RPAP3Q9H6T3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RPAP3Q9H6T3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RPAP3Q9H6T3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPAP3Q9H6T3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPAP3Q9H6T3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPAP3Q9H6T3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPAP3Q9H6T3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPAP3Q9H6T3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPAP3Q9H6T3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPAP3Q9H6T3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RPAP3Q9H6T3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPAP3Q9H6T3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPAP3Q9H6T3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RPAP3Q9H6T3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RPAP3Q9H6T3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RPAP3Q9H6T3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RPAP3Q9H6T3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RPAP3Q9H6T3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RPAP3Q9H6T3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RPAP3Q9H6T3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RPAP3Q9H6T3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPAP3Q9H6T3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RPAP3Q9H6T3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPAP3Q9H6T3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPAP3Q9H6T3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPAP3Q9H6T3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPAP3Q9H6T3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPAP3Q9H6T3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RPAP3Q9H6T3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPAP3Q9H6T3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPAP3Q9H6T3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPAP3Q9H6T3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPAP3Q9H6T3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPAP3Q9H6T3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPAP3Q9H6T3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPAP3Q9H6T3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPAP3Q9H6T3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RPAP3Q9H6T3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPAP3Q9H6T3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPAP3Q9H6T3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RPAP3Q9H6T3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPAP3Q9H6T3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPAP3Q9H6T3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RPAP3Q9H6T3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RPAP3Q9H6T3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
RPAP3Q9H6T3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RPAP3Q9H6T3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPAP3Q9H6T3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPAP3Q9H6T3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPAP3Q9H6T3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPAP3Q9H6T3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPAP3Q9H6T3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPAP3Q9H6T3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPAP3Q9H6T3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPAP3Q9H6T3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPAP3Q9H6T3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPAP3Q9H6T3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPAP3Q9H6T3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPAP3Q9H6T3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPAP3Q9H6T3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPAP3Q9H6T3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPAP3Q9H6T3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPAP3Q9H6T3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPAP3Q9H6T3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPAP3Q9H6T3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RPAP3Q9H6T3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RPAP3Q9H6T3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RPAP3Q9H6T3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPAP3Q9H6T3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPAP3Q9H6T3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPAP3Q9H6T3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPAP3Q9H6T3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPAP3Q9H6T3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPAP3Q9H6T3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPAP3Q9H6T3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms