Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
C11orf49Q9H6J7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
C11orf49Q9H6J7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
C11orf49Q9H6J7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
C11orf49Q9H6J7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
C11orf49Q9H6J7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
C11orf49Q9H6J7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
C11orf49Q9H6J7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
C11orf49Q9H6J7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
C11orf49Q9H6J7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
C11orf49Q9H6J7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
C11orf49Q9H6J7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
C11orf49Q9H6J7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
C11orf49Q9H6J7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
C11orf49Q9H6J7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
C11orf49Q9H6J7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
C11orf49Q9H6J7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
C11orf49Q9H6J7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C11orf49Q9H6J7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
C11orf49Q9H6J7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
C11orf49Q9H6J7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C11orf49Q9H6J7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C11orf49Q9H6J7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
C11orf49Q9H6J7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C11orf49Q9H6J7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
C11orf49Q9H6J7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
C11orf49Q9H6J7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
C11orf49Q9H6J7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
C11orf49Q9H6J7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C11orf49Q9H6J7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C11orf49Q9H6J7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
C11orf49Q9H6J7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
C11orf49Q9H6J7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
C11orf49Q9H6J7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
C11orf49Q9H6J7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C11orf49Q9H6J7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C11orf49Q9H6J7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C11orf49Q9H6J7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C11orf49Q9H6J7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
C11orf49Q9H6J7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C11orf49Q9H6J7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
C11orf49Q9H6J7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
C11orf49Q9H6J7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
C11orf49Q9H6J7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C11orf49Q9H6J7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
C11orf49Q9H6J7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C11orf49Q9H6J7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C11orf49Q9H6J7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
C11orf49Q9H6J7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
C11orf49Q9H6J7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C11orf49Q9H6J7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
C11orf49Q9H6J7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C11orf49Q9H6J7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C11orf49Q9H6J7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C11orf49Q9H6J7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C11orf49Q9H6J7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C11orf49Q9H6J7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
C11orf49Q9H6J7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
C11orf49Q9H6J7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
C11orf49Q9H6J7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
C11orf49Q9H6J7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
C11orf49Q9H6J7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
C11orf49Q9H6J7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C11orf49Q9H6J7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
C11orf49Q9H6J7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
C11orf49Q9H6J7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
C11orf49Q9H6J7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C11orf49Q9H6J7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
C11orf49Q9H6J7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
C11orf49Q9H6J7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C11orf49Q9H6J7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
C11orf49Q9H6J7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
C11orf49Q9H6J7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
C11orf49Q9H6J7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C11orf49Q9H6J7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
C11orf49Q9H6J7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C11orf49Q9H6J7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C11orf49Q9H6J7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
C11orf49Q9H6J7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
C11orf49Q9H6J7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
C11orf49Q9H6J7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
C11orf49Q9H6J7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C11orf49Q9H6J7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C11orf49Q9H6J7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
C11orf49Q9H6J7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C11orf49Q9H6J7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C11orf49Q9H6J7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C11orf49Q9H6J7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C11orf49Q9H6J7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C11orf49Q9H6J7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C11orf49Q9H6J7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C11orf49Q9H6J7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C11orf49Q9H6J7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C11orf49Q9H6J7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C11orf49Q9H6J7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C11orf49Q9H6J7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
C11orf49Q9H6J7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C11orf49Q9H6J7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C11orf49Q9H6J7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C11orf49Q9H6J7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms