Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6I2

SOX17, Transcription factor SOX-17, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX17Q9H6I2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX17Q9H6I2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX17Q9H6I2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX17Q9H6I2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX17Q9H6I2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX17Q9H6I2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX17Q9H6I2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOX17Q9H6I2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX17Q9H6I2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX17Q9H6I2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX17Q9H6I2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX17Q9H6I2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX17Q9H6I2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX17Q9H6I2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX17Q9H6I2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX17Q9H6I2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX17Q9H6I2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOX17Q9H6I2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX17Q9H6I2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX17Q9H6I2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX17Q9H6I2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX17Q9H6I2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX17Q9H6I2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX17Q9H6I2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX17Q9H6I2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX17Q9H6I2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX17Q9H6I2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOX17Q9H6I2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SOX17Q9H6I2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SOX17Q9H6I2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SOX17Q9H6I2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOX17Q9H6I2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SOX17Q9H6I2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOX17Q9H6I2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOX17Q9H6I2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOX17Q9H6I2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOX17Q9H6I2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOX17Q9H6I2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOX17Q9H6I2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOX17Q9H6I2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOX17Q9H6I2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOX17Q9H6I2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOX17Q9H6I2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOX17Q9H6I2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOX17Q9H6I2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOX17Q9H6I2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX17Q9H6I2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX17Q9H6I2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX17Q9H6I2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX17Q9H6I2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX17Q9H6I2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX17Q9H6I2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX17Q9H6I2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX17Q9H6I2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX17Q9H6I2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SOX17Q9H6I2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOX17Q9H6I2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOX17Q9H6I2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOX17Q9H6I2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOX17Q9H6I2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOX17Q9H6I2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOX17Q9H6I2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX17Q9H6I2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX17Q9H6I2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX17Q9H6I2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX17Q9H6I2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX17Q9H6I2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOX17Q9H6I2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX17Q9H6I2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX17Q9H6I2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX17Q9H6I2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX17Q9H6I2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX17Q9H6I2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX17Q9H6I2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX17Q9H6I2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX17Q9H6I2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX17Q9H6I2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX17Q9H6I2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX17Q9H6I2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX17Q9H6I2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX17Q9H6I2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX17Q9H6I2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX17Q9H6I2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX17Q9H6I2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX17Q9H6I2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SOX17Q9H6I2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX17Q9H6I2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX17Q9H6I2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX17Q9H6I2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX17Q9H6I2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX17Q9H6I2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX17Q9H6I2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX17Q9H6I2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX17Q9H6I2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX17Q9H6I2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX17Q9H6I2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX17Q9H6I2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX17Q9H6I2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX17Q9H6I2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX17Q9H6I2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms