Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B9

EPHX3, Epoxide hydrolase 3, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHX3Q9H6B9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPHX3Q9H6B9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPHX3Q9H6B9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPHX3Q9H6B9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPHX3Q9H6B9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPHX3Q9H6B9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
EPHX3Q9H6B9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPHX3Q9H6B9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPHX3Q9H6B9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EPHX3Q9H6B9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EPHX3Q9H6B9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EPHX3Q9H6B9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EPHX3Q9H6B9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EPHX3Q9H6B9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EPHX3Q9H6B9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPHX3Q9H6B9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPHX3Q9H6B9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPHX3Q9H6B9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPHX3Q9H6B9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPHX3Q9H6B9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPHX3Q9H6B9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPHX3Q9H6B9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPHX3Q9H6B9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPHX3Q9H6B9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPHX3Q9H6B9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPHX3Q9H6B9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPHX3Q9H6B9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPHX3Q9H6B9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPHX3Q9H6B9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
EPHX3Q9H6B9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
EPHX3Q9H6B9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPHX3Q9H6B9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPHX3Q9H6B9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPHX3Q9H6B9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPHX3Q9H6B9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPHX3Q9H6B9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPHX3Q9H6B9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
EPHX3Q9H6B9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPHX3Q9H6B9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPHX3Q9H6B9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPHX3Q9H6B9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPHX3Q9H6B9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
EPHX3Q9H6B9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
EPHX3Q9H6B9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPHX3Q9H6B9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPHX3Q9H6B9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPHX3Q9H6B9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPHX3Q9H6B9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPHX3Q9H6B9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPHX3Q9H6B9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPHX3Q9H6B9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPHX3Q9H6B9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPHX3Q9H6B9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPHX3Q9H6B9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPHX3Q9H6B9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPHX3Q9H6B9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPHX3Q9H6B9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPHX3Q9H6B9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPHX3Q9H6B9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPHX3Q9H6B9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPHX3Q9H6B9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPHX3Q9H6B9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPHX3Q9H6B9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPHX3Q9H6B9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPHX3Q9H6B9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPHX3Q9H6B9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPHX3Q9H6B9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPHX3Q9H6B9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPHX3Q9H6B9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPHX3Q9H6B9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPHX3Q9H6B9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPHX3Q9H6B9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
EPHX3Q9H6B9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHX3Q9H6B9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHX3Q9H6B9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHX3Q9H6B9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHX3Q9H6B9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHX3Q9H6B9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHX3Q9H6B9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHX3Q9H6B9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHX3Q9H6B9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHX3Q9H6B9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHX3Q9H6B9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHX3Q9H6B9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHX3Q9H6B9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EPHX3Q9H6B9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPHX3Q9H6B9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPHX3Q9H6B9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPHX3Q9H6B9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPHX3Q9H6B9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPHX3Q9H6B9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EPHX3Q9H6B9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPHX3Q9H6B9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPHX3Q9H6B9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPHX3Q9H6B9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPHX3Q9H6B9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPHX3Q9H6B9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPHX3Q9H6B9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EPHX3Q9H6B9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EPHX3Q9H6B9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1341.4 ms