Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2E6

SEMA6A, Semaphorin-6A, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6AQ9H2E6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA6AQ9H2E6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA6AQ9H2E6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA6AQ9H2E6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA6AQ9H2E6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA6AQ9H2E6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA6AQ9H2E6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA6AQ9H2E6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA6AQ9H2E6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA6AQ9H2E6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA6AQ9H2E6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA6AQ9H2E6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA6AQ9H2E6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA6AQ9H2E6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA6AQ9H2E6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA6AQ9H2E6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA6AQ9H2E6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA6AQ9H2E6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA6AQ9H2E6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA6AQ9H2E6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEMA6AQ9H2E6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA6AQ9H2E6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA6AQ9H2E6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA6AQ9H2E6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA6AQ9H2E6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA6AQ9H2E6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA6AQ9H2E6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA6AQ9H2E6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA6AQ9H2E6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SEMA6AQ9H2E6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA6AQ9H2E6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA6AQ9H2E6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA6AQ9H2E6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA6AQ9H2E6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA6AQ9H2E6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA6AQ9H2E6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SEMA6AQ9H2E6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA6AQ9H2E6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA6AQ9H2E6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA6AQ9H2E6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA6AQ9H2E6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SEMA6AQ9H2E6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SEMA6AQ9H2E6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA6AQ9H2E6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA6AQ9H2E6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA6AQ9H2E6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA6AQ9H2E6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA6AQ9H2E6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA6AQ9H2E6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SEMA6AQ9H2E6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA6AQ9H2E6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA6AQ9H2E6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA6AQ9H2E6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA6AQ9H2E6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA6AQ9H2E6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA6AQ9H2E6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA6AQ9H2E6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA6AQ9H2E6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA6AQ9H2E6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA6AQ9H2E6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA6AQ9H2E6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA6AQ9H2E6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA6AQ9H2E6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA6AQ9H2E6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA6AQ9H2E6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA6AQ9H2E6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA6AQ9H2E6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA6AQ9H2E6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA6AQ9H2E6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA6AQ9H2E6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA6AQ9H2E6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA6AQ9H2E6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA6AQ9H2E6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA6AQ9H2E6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA6AQ9H2E6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA6AQ9H2E6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA6AQ9H2E6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA6AQ9H2E6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA6AQ9H2E6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA6AQ9H2E6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA6AQ9H2E6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA6AQ9H2E6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA6AQ9H2E6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA6AQ9H2E6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA6AQ9H2E6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA6AQ9H2E6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA6AQ9H2E6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA6AQ9H2E6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA6AQ9H2E6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA6AQ9H2E6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA6AQ9H2E6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA6AQ9H2E6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA6AQ9H2E6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA6AQ9H2E6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA6AQ9H2E6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA6AQ9H2E6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA6AQ9H2E6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA6AQ9H2E6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA6AQ9H2E6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA6AQ9H2E6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms