Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
EHD4Q9H223 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
EHD4Q9H223 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.52■■■□□ 2
EHD4Q9H223 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EHD4Q9H223 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EHD4Q9H223 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
EHD4Q9H223 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EHD4Q9H223 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EHD4Q9H223 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EHD4Q9H223 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EHD4Q9H223 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EHD4Q9H223 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EHD4Q9H223 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
EHD4Q9H223 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EHD4Q9H223 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EHD4Q9H223 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EHD4Q9H223 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EHD4Q9H223 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EHD4Q9H223 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EHD4Q9H223 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EHD4Q9H223 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EHD4Q9H223 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EHD4Q9H223 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EHD4Q9H223 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EHD4Q9H223 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EHD4Q9H223 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EHD4Q9H223 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EHD4Q9H223 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
EHD4Q9H223 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EHD4Q9H223 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EHD4Q9H223 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
EHD4Q9H223 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EHD4Q9H223 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EHD4Q9H223 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EHD4Q9H223 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EHD4Q9H223 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EHD4Q9H223 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EHD4Q9H223 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EHD4Q9H223 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EHD4Q9H223 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EHD4Q9H223 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EHD4Q9H223 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EHD4Q9H223 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EHD4Q9H223 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EHD4Q9H223 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EHD4Q9H223 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EHD4Q9H223 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EHD4Q9H223 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EHD4Q9H223 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EHD4Q9H223 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
EHD4Q9H223 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
EHD4Q9H223 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
EHD4Q9H223 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EHD4Q9H223 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EHD4Q9H223 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EHD4Q9H223 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EHD4Q9H223 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EHD4Q9H223 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EHD4Q9H223 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EHD4Q9H223 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EHD4Q9H223 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EHD4Q9H223 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EHD4Q9H223 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EHD4Q9H223 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EHD4Q9H223 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EHD4Q9H223 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EHD4Q9H223 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EHD4Q9H223 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EHD4Q9H223 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EHD4Q9H223 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EHD4Q9H223 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EHD4Q9H223 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EHD4Q9H223 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EHD4Q9H223 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EHD4Q9H223 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EHD4Q9H223 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EHD4Q9H223 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EHD4Q9H223 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
EHD4Q9H223 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EHD4Q9H223 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EHD4Q9H223 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EHD4Q9H223 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EHD4Q9H223 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EHD4Q9H223 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EHD4Q9H223 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
EHD4Q9H223 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EHD4Q9H223 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EHD4Q9H223 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EHD4Q9H223 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EHD4Q9H223 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EHD4Q9H223 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
EHD4Q9H223 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
EHD4Q9H223 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EHD4Q9H223 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
EHD4Q9H223 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EHD4Q9H223 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EHD4Q9H223 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EHD4Q9H223 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EHD4Q9H223 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EHD4Q9H223 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms