Protein–RNA interactions for Protein: Q9H159

CDH19, Cadherin-19, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH19Q9H159 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH19Q9H159 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDH19Q9H159 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH19Q9H159 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH19Q9H159 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH19Q9H159 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH19Q9H159 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH19Q9H159 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH19Q9H159 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH19Q9H159 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH19Q9H159 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH19Q9H159 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH19Q9H159 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH19Q9H159 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH19Q9H159 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH19Q9H159 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH19Q9H159 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH19Q9H159 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH19Q9H159 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH19Q9H159 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH19Q9H159 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH19Q9H159 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH19Q9H159 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH19Q9H159 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH19Q9H159 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH19Q9H159 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH19Q9H159 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH19Q9H159 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH19Q9H159 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH19Q9H159 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH19Q9H159 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH19Q9H159 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH19Q9H159 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH19Q9H159 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH19Q9H159 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH19Q9H159 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH19Q9H159 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH19Q9H159 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH19Q9H159 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH19Q9H159 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH19Q9H159 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH19Q9H159 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH19Q9H159 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH19Q9H159 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH19Q9H159 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH19Q9H159 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH19Q9H159 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH19Q9H159 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH19Q9H159 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH19Q9H159 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH19Q9H159 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDH19Q9H159 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CDH19Q9H159 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDH19Q9H159 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CDH19Q9H159 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH19Q9H159 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH19Q9H159 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH19Q9H159 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH19Q9H159 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH19Q9H159 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH19Q9H159 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH19Q9H159 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH19Q9H159 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDH19Q9H159 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH19Q9H159 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH19Q9H159 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH19Q9H159 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH19Q9H159 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH19Q9H159 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDH19Q9H159 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH19Q9H159 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH19Q9H159 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH19Q9H159 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH19Q9H159 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH19Q9H159 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH19Q9H159 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH19Q9H159 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH19Q9H159 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH19Q9H159 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH19Q9H159 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH19Q9H159 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH19Q9H159 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH19Q9H159 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH19Q9H159 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH19Q9H159 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH19Q9H159 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH19Q9H159 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH19Q9H159 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH19Q9H159 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH19Q9H159 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH19Q9H159 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH19Q9H159 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH19Q9H159 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH19Q9H159 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH19Q9H159 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH19Q9H159 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH19Q9H159 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH19Q9H159 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH19Q9H159 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH19Q9H159 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms