Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMG9Q9H0W8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMG9Q9H0W8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMG9Q9H0W8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMG9Q9H0W8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMG9Q9H0W8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMG9Q9H0W8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMG9Q9H0W8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMG9Q9H0W8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMG9Q9H0W8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMG9Q9H0W8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMG9Q9H0W8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMG9Q9H0W8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMG9Q9H0W8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMG9Q9H0W8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMG9Q9H0W8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMG9Q9H0W8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMG9Q9H0W8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMG9Q9H0W8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMG9Q9H0W8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMG9Q9H0W8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMG9Q9H0W8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMG9Q9H0W8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMG9Q9H0W8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SMG9Q9H0W8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMG9Q9H0W8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMG9Q9H0W8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
SMG9Q9H0W8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMG9Q9H0W8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMG9Q9H0W8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMG9Q9H0W8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMG9Q9H0W8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMG9Q9H0W8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMG9Q9H0W8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMG9Q9H0W8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMG9Q9H0W8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMG9Q9H0W8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMG9Q9H0W8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMG9Q9H0W8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMG9Q9H0W8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMG9Q9H0W8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMG9Q9H0W8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMG9Q9H0W8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMG9Q9H0W8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMG9Q9H0W8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMG9Q9H0W8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMG9Q9H0W8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMG9Q9H0W8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMG9Q9H0W8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMG9Q9H0W8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMG9Q9H0W8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMG9Q9H0W8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMG9Q9H0W8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMG9Q9H0W8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMG9Q9H0W8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMG9Q9H0W8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMG9Q9H0W8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMG9Q9H0W8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMG9Q9H0W8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SMG9Q9H0W8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMG9Q9H0W8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMG9Q9H0W8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMG9Q9H0W8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMG9Q9H0W8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMG9Q9H0W8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMG9Q9H0W8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMG9Q9H0W8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMG9Q9H0W8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMG9Q9H0W8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMG9Q9H0W8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMG9Q9H0W8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMG9Q9H0W8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SMG9Q9H0W8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMG9Q9H0W8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMG9Q9H0W8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMG9Q9H0W8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SMG9Q9H0W8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMG9Q9H0W8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMG9Q9H0W8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SMG9Q9H0W8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SMG9Q9H0W8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMG9Q9H0W8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMG9Q9H0W8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMG9Q9H0W8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SMG9Q9H0W8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMG9Q9H0W8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMG9Q9H0W8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMG9Q9H0W8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMG9Q9H0W8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMG9Q9H0W8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMG9Q9H0W8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMG9Q9H0W8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMG9Q9H0W8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMG9Q9H0W8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMG9Q9H0W8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMG9Q9H0W8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMG9Q9H0W8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMG9Q9H0W8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMG9Q9H0W8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMG9Q9H0W8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms