Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B1

FTO, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase FTO, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FTOQ9C0B1 GRB2-205ENST00000392564 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.555e-18■■■□□ 16.4
FTOQ9C0B1 GRB2-208ENST00000578961 687 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.555e-18■■■□□ 16.4
FTOQ9C0B1 MTA2-203ENST00000526844 627 ntTSL 311.51□□□□□ -0.572e-9■■■□□ 16.4
FTOQ9C0B1 GRB2-211ENST00000583912 561 ntTSL 49.77□□□□□ -0.855e-18■■■□□ 16.4
FTOQ9C0B1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.491e-6■■■□□ 16.3
FTOQ9C0B1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.411e-6■■■□□ 16.3
FTOQ9C0B1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.251e-6■■■□□ 16.3
FTOQ9C0B1 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.81e-6■■■□□ 16.3
FTOQ9C0B1 PSME4-208ENST00000481518 886 ntTSL 526.32■■□□□ 1.86e-11■■■□□ 16.3
FTOQ9C0B1 PSME4-201ENST00000389993 6581 ntTSL 1 (best)16.5■□□□□ 0.236e-11■■■□□ 16.3
FTOQ9C0B1 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.046e-11■■■□□ 16.3
FTOQ9C0B1 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.029e-15■■■□□ 16.3
FTOQ9C0B1 OAZ1-210ENST00000593012 1357 ntTSL 221.14■□□□□ 0.989e-15■■■□□ 16.3
FTOQ9C0B1 OAZ1-201ENST00000581150 1131 ntTSL 519.34■□□□□ 0.699e-15■■■□□ 16.3
FTOQ9C0B1 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.679e-15■■■□□ 16.3
FTOQ9C0B1 OAZ1-209ENST00000592787 857 ntTSL 218.45■□□□□ 0.549e-15■■■□□ 16.3
FTOQ9C0B1 OAZ1-207ENST00000590943 1012 ntTSL 218.08■□□□□ 0.489e-15■■■□□ 16.3
FTOQ9C0B1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.29■■■□□ 2.923e-6■■■□□ 16.3
FTOQ9C0B1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.713e-6■■■□□ 16.3
FTOQ9C0B1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.552e-10■■■□□ 16.3
FTOQ9C0B1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.512e-10■■■□□ 16.3
FTOQ9C0B1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.282e-10■■■□□ 16.3
FTOQ9C0B1 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.072e-7■■■□□ 16.3
FTOQ9C0B1 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.772e-7■■■□□ 16.3
FTOQ9C0B1 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.412e-10■■■□□ 16.3
FTOQ9C0B1 ZNF331-211ENST00000509047 670 ntTSL 316.71■□□□□ 0.272e-10■■■□□ 16.3
FTOQ9C0B1 ZNF331-221ENST00000514022 913 ntTSL 216.52■□□□□ 0.242e-10■■■□□ 16.3
FTOQ9C0B1 ZNF331-209ENST00000505426 688 ntTSL 215.51■□□□□ 0.072e-10■■■□□ 16.3
FTOQ9C0B1 ZNF331-215ENST00000511567 540 ntTSL 414.99□□□□□ -0.012e-10■■■□□ 16.3
FTOQ9C0B1 ZNF331-207ENST00000504493 641 ntTSL 1 (best)14.38□□□□□ -0.112e-10■■■□□ 16.3
FTOQ9C0B1 ZNF331-201ENST00000253144 5042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.232e-10■■■□□ 16.3
FTOQ9C0B1 ZNF331-213ENST00000509585 562 ntTSL 513.55□□□□□ -0.242e-10■■■□□ 16.3
FTOQ9C0B1 ZNF331-210ENST00000505949 761 ntTSL 513.31□□□□□ -0.282e-10■■■□□ 16.3
FTOQ9C0B1 ZNF331-218ENST00000513265 739 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.282e-10■■■□□ 16.3
FTOQ9C0B1 ZNF331-204ENST00000502248 670 ntTSL 1 (best)12.51□□□□□ -0.412e-10■■■□□ 16.3
FTOQ9C0B1 ZNF331-220ENST00000513999 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.512e-10■■■□□ 16.3
FTOQ9C0B1 ZNF331-216ENST00000511593 1985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.842e-10■■■□□ 16.3
FTOQ9C0B1 ZNF331-205ENST00000502616 573 ntTSL 1 (best)9.78□□□□□ -0.842e-10■■■□□ 16.3
FTOQ9C0B1 ZNF331-222ENST00000514374 574 ntTSL 49.51□□□□□ -0.892e-10■■■□□ 16.3
FTOQ9C0B1 ZNF331-203ENST00000449416 3817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.972e-10■■■□□ 16.3
FTOQ9C0B1 CASD1-204ENST00000447923 532 ntTSL 43.75□□□□□ -1.812e-7■■■□□ 16.3
FTOQ9C0B1 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.069e-12■■■□□ 16.3
FTOQ9C0B1 HYOU1-215ENST00000543287 2464 ntTSL 220.32■□□□□ 0.849e-12■■■□□ 16.3
FTOQ9C0B1 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.339e-12■■■□□ 16.3
FTOQ9C0B1 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.289e-12■■■□□ 16.3
FTOQ9C0B1 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.029e-12■■■□□ 16.3
FTOQ9C0B1 HYOU1-221ENST00000621959 3358 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.029e-12■■■□□ 16.3
FTOQ9C0B1 HYOU1-217ENST00000612687 4360 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.199e-12■■■□□ 16.3
FTOQ9C0B1 PTMS-205ENST00000540828 644 ntTSL 1 (best)24.11■■□□□ 1.452e-9■■■□□ 16.3
FTOQ9C0B1 PTMS-203ENST00000538057 976 ntTSL 223.37■■□□□ 1.332e-9■■■□□ 16.3
FTOQ9C0B1 DNAJB9-203ENST00000491582 584 ntTSL 223.48■■□□□ 1.351e-9■■■□□ 16.3
FTOQ9C0B1 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.561e-9■■■□□ 16.3
FTOQ9C0B1 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.681e-6■■■□□ 16.3
FTOQ9C0B1 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.231e-6■■■□□ 16.3
FTOQ9C0B1 CTNNB1-203ENST00000396185 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.171e-6■■■□□ 16.3
FTOQ9C0B1 CTNNB1-201ENST00000349496 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.221e-6■■■□□ 16.3
FTOQ9C0B1 CTNNB1-206ENST00000431914 634 ntTSL 412.97□□□□□ -0.331e-6■■■□□ 16.3
FTOQ9C0B1 CTNNB1-204ENST00000405570 2513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.541e-6■■■□□ 16.3
FTOQ9C0B1 CTNNB1-207ENST00000433400 596 ntTSL 45.63□□□□□ -1.511e-6■■■□□ 16.3
FTOQ9C0B1 CTNNB1-205ENST00000426215 563 ntTSL 44.39□□□□□ -1.711e-6■■■□□ 16.3
FTOQ9C0B1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.132e-6■■■□□ 16.3
FTOQ9C0B1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.662e-6■■■□□ 16.3
FTOQ9C0B1 PFKL-205ENST00000466134 5986 ntTSL 221.78■■□□□ 1.081e-7■■■□□ 16.2
FTOQ9C0B1 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.931e-7■■■□□ 16.2
FTOQ9C0B1 PFKL-202ENST00000397961 3390 ntTSL 1 (best)17.67■□□□□ 0.421e-7■■■□□ 16.2
FTOQ9C0B1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.863e-6■■■□□ 16.2
FTOQ9C0B1 MAP2K2-208ENST00000599345 923 ntTSL 522.97■■□□□ 1.273e-6■■■□□ 16.2
FTOQ9C0B1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.133e-6■■■□□ 16.2
FTOQ9C0B1 CHD6-204ENST00000440647 536 ntTSL 36.83□□□□□ -1.321e-11■■■□□ 16.2
FTOQ9C0B1 ASPSCR1-210ENST00000581608 2387 ntTSL 224.25■■□□□ 1.471e-6■■■□□ 16.2
FTOQ9C0B1 ASPSCR1-205ENST00000578236 3277 ntTSL 215.83■□□□□ 0.131e-6■■■□□ 16.2
FTOQ9C0B1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.852e-6■■■□□ 16.1
FTOQ9C0B1 KSR1-211ENST00000580163 479 ntTSL 325.69■■□□□ 1.72e-7■■■□□ 16.1
FTOQ9C0B1 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.712e-7■■■□□ 16.1
FTOQ9C0B1 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.622e-7■■■□□ 16.1
FTOQ9C0B1 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.52e-7■■■□□ 16.1
FTOQ9C0B1 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.22e-7■■■□□ 16.1
FTOQ9C0B1 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.152e-7■■■□□ 16.1
FTOQ9C0B1 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.092e-7■■■□□ 16.1
FTOQ9C0B1 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.022e-7■■■□□ 16.1
FTOQ9C0B1 SMARCA4-216ENST00000591545 5193 ntTSL 214.46□□□□□ -0.12e-7■■■□□ 16.1
FTOQ9C0B1 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.12e-7■■■□□ 16.1
FTOQ9C0B1 KSR1-208ENST00000579309 343 ntTSL 56.62□□□□□ -1.352e-7■■■□□ 16.1
FTOQ9C0B1 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.022e-7■■■□□ 16.1
FTOQ9C0B1 THUMPD3-AS1-209ENST00000518437 240 ntTSL 220.15■□□□□ 0.825e-6■■■□□ 16
FTOQ9C0B1 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.215e-6■■■□□ 16
FTOQ9C0B1 THUMPD3-AS1-203ENST00000469846 670 ntTSL 313.65□□□□□ -0.225e-6■■■□□ 16
FTOQ9C0B1 THUMPD3-AS1-205ENST00000481221 683 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.835e-6■■■□□ 16
FTOQ9C0B1 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.525e-6■■■□□ 16
FTOQ9C0B1 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.535e-6■■■□□ 16
FTOQ9C0B1 THUMPD3-AS1-218ENST00000522525 1867 ntTSL 1 (best)5.51□□□□□ -1.535e-6■■■□□ 16
FTOQ9C0B1 THUMPD3-AS1-201ENST00000467069 667 ntTSL 54.6□□□□□ -1.675e-6■■■□□ 16
FTOQ9C0B1 THUMPD3-AS1-216ENST00000521708 549 ntTSL 34.49□□□□□ -1.695e-6■■■□□ 16
FTOQ9C0B1 THUMPD3-AS1-207ENST00000494680 544 ntTSL 54.28□□□□□ -1.725e-6■■■□□ 16
FTOQ9C0B1 UGP2-223ENST00000493222 864 ntTSL 323.98■■□□□ 1.436e-7■■■□□ 15.9
FTOQ9C0B1 UGP2-212ENST00000480679 505 ntTSL 523.98■■□□□ 1.436e-7■■■□□ 15.9
FTOQ9C0B1 UGP2-227ENST00000497510 722 ntTSL 423.18■■□□□ 1.36e-7■■■□□ 15.9
FTOQ9C0B1 UGP2-219ENST00000487469 1015 ntTSL 521.46■■□□□ 1.036e-7■■■□□ 15.9
FTOQ9C0B1 UGP2-213ENST00000482668 645 ntTSL 320.93■□□□□ 0.946e-7■■■□□ 15.9
FTOQ9C0B1 UGP2-215ENST00000483461 495 ntTSL 420.69■□□□□ 0.96e-7■■■□□ 15.9
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