Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZS1

FOXP3, Forkhead box protein P3, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP3Q9BZS1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXP3Q9BZS1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXP3Q9BZS1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXP3Q9BZS1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXP3Q9BZS1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXP3Q9BZS1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXP3Q9BZS1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXP3Q9BZS1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXP3Q9BZS1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXP3Q9BZS1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXP3Q9BZS1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXP3Q9BZS1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXP3Q9BZS1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXP3Q9BZS1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXP3Q9BZS1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FOXP3Q9BZS1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FOXP3Q9BZS1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FOXP3Q9BZS1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FOXP3Q9BZS1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOXP3Q9BZS1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOXP3Q9BZS1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOXP3Q9BZS1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXP3Q9BZS1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXP3Q9BZS1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXP3Q9BZS1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXP3Q9BZS1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXP3Q9BZS1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXP3Q9BZS1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXP3Q9BZS1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXP3Q9BZS1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXP3Q9BZS1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXP3Q9BZS1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXP3Q9BZS1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXP3Q9BZS1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXP3Q9BZS1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXP3Q9BZS1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXP3Q9BZS1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXP3Q9BZS1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXP3Q9BZS1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXP3Q9BZS1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXP3Q9BZS1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXP3Q9BZS1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXP3Q9BZS1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXP3Q9BZS1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXP3Q9BZS1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXP3Q9BZS1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXP3Q9BZS1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXP3Q9BZS1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXP3Q9BZS1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXP3Q9BZS1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXP3Q9BZS1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXP3Q9BZS1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXP3Q9BZS1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXP3Q9BZS1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXP3Q9BZS1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXP3Q9BZS1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXP3Q9BZS1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXP3Q9BZS1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXP3Q9BZS1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXP3Q9BZS1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXP3Q9BZS1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXP3Q9BZS1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXP3Q9BZS1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXP3Q9BZS1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXP3Q9BZS1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXP3Q9BZS1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXP3Q9BZS1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXP3Q9BZS1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXP3Q9BZS1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXP3Q9BZS1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXP3Q9BZS1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXP3Q9BZS1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXP3Q9BZS1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FOXP3Q9BZS1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FOXP3Q9BZS1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXP3Q9BZS1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXP3Q9BZS1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXP3Q9BZS1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXP3Q9BZS1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXP3Q9BZS1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXP3Q9BZS1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXP3Q9BZS1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXP3Q9BZS1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXP3Q9BZS1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXP3Q9BZS1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXP3Q9BZS1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXP3Q9BZS1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXP3Q9BZS1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXP3Q9BZS1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXP3Q9BZS1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXP3Q9BZS1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXP3Q9BZS1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXP3Q9BZS1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXP3Q9BZS1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXP3Q9BZS1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXP3Q9BZS1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXP3Q9BZS1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXP3Q9BZS1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXP3Q9BZS1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXP3Q9BZS1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms