Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
YTHDF1Q9BYJ9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
YTHDF1Q9BYJ9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
YTHDF1Q9BYJ9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
YTHDF1Q9BYJ9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
YTHDF1Q9BYJ9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
YTHDF1Q9BYJ9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
YTHDF1Q9BYJ9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
YTHDF1Q9BYJ9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
YTHDF1Q9BYJ9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
YTHDF1Q9BYJ9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
YTHDF1Q9BYJ9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
YTHDF1Q9BYJ9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
YTHDF1Q9BYJ9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
YTHDF1Q9BYJ9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
YTHDF1Q9BYJ9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
YTHDF1Q9BYJ9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
YTHDF1Q9BYJ9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
YTHDF1Q9BYJ9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
YTHDF1Q9BYJ9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
YTHDF1Q9BYJ9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
YTHDF1Q9BYJ9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
YTHDF1Q9BYJ9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
YTHDF1Q9BYJ9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
YTHDF1Q9BYJ9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
YTHDF1Q9BYJ9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
YTHDF1Q9BYJ9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
YTHDF1Q9BYJ9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
YTHDF1Q9BYJ9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
YTHDF1Q9BYJ9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
YTHDF1Q9BYJ9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
YTHDF1Q9BYJ9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
YTHDF1Q9BYJ9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
YTHDF1Q9BYJ9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
YTHDF1Q9BYJ9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
YTHDF1Q9BYJ9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
YTHDF1Q9BYJ9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
YTHDF1Q9BYJ9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
YTHDF1Q9BYJ9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
YTHDF1Q9BYJ9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
YTHDF1Q9BYJ9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
YTHDF1Q9BYJ9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
YTHDF1Q9BYJ9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
YTHDF1Q9BYJ9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
YTHDF1Q9BYJ9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
YTHDF1Q9BYJ9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
YTHDF1Q9BYJ9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
YTHDF1Q9BYJ9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
YTHDF1Q9BYJ9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
YTHDF1Q9BYJ9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
YTHDF1Q9BYJ9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
YTHDF1Q9BYJ9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
YTHDF1Q9BYJ9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
YTHDF1Q9BYJ9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
YTHDF1Q9BYJ9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
YTHDF1Q9BYJ9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
YTHDF1Q9BYJ9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
YTHDF1Q9BYJ9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
YTHDF1Q9BYJ9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
YTHDF1Q9BYJ9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
YTHDF1Q9BYJ9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
YTHDF1Q9BYJ9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
YTHDF1Q9BYJ9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
YTHDF1Q9BYJ9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
YTHDF1Q9BYJ9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
YTHDF1Q9BYJ9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
YTHDF1Q9BYJ9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
YTHDF1Q9BYJ9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
YTHDF1Q9BYJ9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
YTHDF1Q9BYJ9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
YTHDF1Q9BYJ9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
YTHDF1Q9BYJ9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
YTHDF1Q9BYJ9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
YTHDF1Q9BYJ9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
YTHDF1Q9BYJ9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
YTHDF1Q9BYJ9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
YTHDF1Q9BYJ9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
YTHDF1Q9BYJ9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
YTHDF1Q9BYJ9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
YTHDF1Q9BYJ9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
YTHDF1Q9BYJ9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
YTHDF1Q9BYJ9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
YTHDF1Q9BYJ9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
YTHDF1Q9BYJ9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
YTHDF1Q9BYJ9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
YTHDF1Q9BYJ9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
YTHDF1Q9BYJ9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
YTHDF1Q9BYJ9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
YTHDF1Q9BYJ9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
YTHDF1Q9BYJ9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
YTHDF1Q9BYJ9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
YTHDF1Q9BYJ9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
YTHDF1Q9BYJ9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
YTHDF1Q9BYJ9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
YTHDF1Q9BYJ9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
YTHDF1Q9BYJ9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms