Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
SCAPERQ9BY12 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
SCAPERQ9BY12 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
SCAPERQ9BY12 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
SCAPERQ9BY12 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
SCAPERQ9BY12 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
SCAPERQ9BY12 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
SCAPERQ9BY12 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
SCAPERQ9BY12 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
SCAPERQ9BY12 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
SCAPERQ9BY12 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
SCAPERQ9BY12 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
SCAPERQ9BY12 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
SCAPERQ9BY12 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
SCAPERQ9BY12 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
SCAPERQ9BY12 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
SCAPERQ9BY12 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
SCAPERQ9BY12 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
SCAPERQ9BY12 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
SCAPERQ9BY12 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
SCAPERQ9BY12 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
SCAPERQ9BY12 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
SCAPERQ9BY12 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
SCAPERQ9BY12 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
SCAPERQ9BY12 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
SCAPERQ9BY12 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
SCAPERQ9BY12 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
SCAPERQ9BY12 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
SCAPERQ9BY12 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
SCAPERQ9BY12 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
SCAPERQ9BY12 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
SCAPERQ9BY12 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
SCAPERQ9BY12 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
SCAPERQ9BY12 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC35.45■■■■□ 3.27
SCAPERQ9BY12 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
SCAPERQ9BY12 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
SCAPERQ9BY12 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
SCAPERQ9BY12 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
SCAPERQ9BY12 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
SCAPERQ9BY12 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
SCAPERQ9BY12 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
SCAPERQ9BY12 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
SCAPERQ9BY12 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
SCAPERQ9BY12 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
SCAPERQ9BY12 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
SCAPERQ9BY12 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
SCAPERQ9BY12 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
SCAPERQ9BY12 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
SCAPERQ9BY12 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
SCAPERQ9BY12 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
SCAPERQ9BY12 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
SCAPERQ9BY12 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC35.42■■■■□ 3.26
SCAPERQ9BY12 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
SCAPERQ9BY12 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
SCAPERQ9BY12 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
SCAPERQ9BY12 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
SCAPERQ9BY12 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
SCAPERQ9BY12 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
SCAPERQ9BY12 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
SCAPERQ9BY12 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
SCAPERQ9BY12 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
SCAPERQ9BY12 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
SCAPERQ9BY12 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
SCAPERQ9BY12 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
SCAPERQ9BY12 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
SCAPERQ9BY12 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
SCAPERQ9BY12 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
SCAPERQ9BY12 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
SCAPERQ9BY12 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
SCAPERQ9BY12 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
SCAPERQ9BY12 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
SCAPERQ9BY12 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
SCAPERQ9BY12 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
SCAPERQ9BY12 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
SCAPERQ9BY12 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
SCAPERQ9BY12 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
SCAPERQ9BY12 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
SCAPERQ9BY12 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
SCAPERQ9BY12 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
SCAPERQ9BY12 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
SCAPERQ9BY12 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
SCAPERQ9BY12 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
SCAPERQ9BY12 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
SCAPERQ9BY12 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
SCAPERQ9BY12 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
SCAPERQ9BY12 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
SCAPERQ9BY12 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
SCAPERQ9BY12 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
SCAPERQ9BY12 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
SCAPERQ9BY12 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
SCAPERQ9BY12 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
SCAPERQ9BY12 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
SCAPERQ9BY12 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
SCAPERQ9BY12 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
SCAPERQ9BY12 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
SCAPERQ9BY12 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
SCAPERQ9BY12 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
SCAPERQ9BY12 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
SCAPERQ9BY12 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
SCAPERQ9BY12 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms