Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW9

FANCD2, Fanconi anemia group D2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCD2Q9BXW9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
FANCD2Q9BXW9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.04
FANCD2Q9BXW9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
FANCD2Q9BXW9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
FANCD2Q9BXW9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.04
FANCD2Q9BXW9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
FANCD2Q9BXW9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
FANCD2Q9BXW9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
FANCD2Q9BXW9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
FANCD2Q9BXW9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC40.3■■■■■ 4.04
FANCD2Q9BXW9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC40.3■■■■■ 4.04
FANCD2Q9BXW9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
FANCD2Q9BXW9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC40.3■■■■■ 4.04
FANCD2Q9BXW9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
FANCD2Q9BXW9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
FANCD2Q9BXW9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
FANCD2Q9BXW9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC40.29■■■■■ 4.04
FANCD2Q9BXW9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC40.29■■■■■ 4.04
FANCD2Q9BXW9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
FANCD2Q9BXW9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC40.28■■■■■ 4.04
FANCD2Q9BXW9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC40.28■■■■■ 4.04
FANCD2Q9BXW9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
FANCD2Q9BXW9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
FANCD2Q9BXW9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC40.28■■■■■ 4.04
FANCD2Q9BXW9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
FANCD2Q9BXW9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC40.27■■■■■ 4.04
FANCD2Q9BXW9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
FANCD2Q9BXW9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
FANCD2Q9BXW9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
FANCD2Q9BXW9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC40.26■■■■■ 4.04
FANCD2Q9BXW9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC40.26■■■■■ 4.04
FANCD2Q9BXW9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC40.26■■■■■ 4.04
FANCD2Q9BXW9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.03
FANCD2Q9BXW9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.03
FANCD2Q9BXW9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC40.26■■■■■ 4.03
FANCD2Q9BXW9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
FANCD2Q9BXW9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC40.25■■■■■ 4.03
FANCD2Q9BXW9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC40.25■■■■■ 4.03
FANCD2Q9BXW9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC40.25■■■■■ 4.03
FANCD2Q9BXW9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC40.25■■■■■ 4.03
FANCD2Q9BXW9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
FANCD2Q9BXW9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
FANCD2Q9BXW9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
FANCD2Q9BXW9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
FANCD2Q9BXW9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
FANCD2Q9BXW9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
FANCD2Q9BXW9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
FANCD2Q9BXW9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC40.22■■■■■ 4.03
FANCD2Q9BXW9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
FANCD2Q9BXW9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC40.22■■■■■ 4.03
FANCD2Q9BXW9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
FANCD2Q9BXW9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.22■■■■■ 4.03
FANCD2Q9BXW9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
FANCD2Q9BXW9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC40.21■■■■■ 4.03
FANCD2Q9BXW9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC40.21■■■■■ 4.03
FANCD2Q9BXW9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC40.21■■■■■ 4.03
FANCD2Q9BXW9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
FANCD2Q9BXW9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
FANCD2Q9BXW9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.21■■■■■ 4.03
FANCD2Q9BXW9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
FANCD2Q9BXW9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
FANCD2Q9BXW9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC40.2■■■■■ 4.03
FANCD2Q9BXW9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
FANCD2Q9BXW9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.2■■■■■ 4.03
FANCD2Q9BXW9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.03
FANCD2Q9BXW9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
FANCD2Q9BXW9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
FANCD2Q9BXW9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
FANCD2Q9BXW9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
FANCD2Q9BXW9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
FANCD2Q9BXW9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
FANCD2Q9BXW9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC40.17■■■■■ 4.02
FANCD2Q9BXW9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC40.17■■■■■ 4.02
FANCD2Q9BXW9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.17■■■■■ 4.02
FANCD2Q9BXW9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC40.17■■■■■ 4.02
FANCD2Q9BXW9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC40.17■■■■■ 4.02
FANCD2Q9BXW9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
FANCD2Q9BXW9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.17■■■■■ 4.02
FANCD2Q9BXW9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
FANCD2Q9BXW9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
FANCD2Q9BXW9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
FANCD2Q9BXW9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
FANCD2Q9BXW9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
FANCD2Q9BXW9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
FANCD2Q9BXW9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
FANCD2Q9BXW9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC40.15■■■■■ 4.02
FANCD2Q9BXW9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC40.15■■■■■ 4.02
FANCD2Q9BXW9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
FANCD2Q9BXW9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
FANCD2Q9BXW9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC40.15■■■■■ 4.02
FANCD2Q9BXW9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.15■■■■■ 4.02
FANCD2Q9BXW9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
FANCD2Q9BXW9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
FANCD2Q9BXW9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
FANCD2Q9BXW9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
FANCD2Q9BXW9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
FANCD2Q9BXW9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
FANCD2Q9BXW9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
FANCD2Q9BXW9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
FANCD2Q9BXW9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms