Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL8

CDCA4, Cell division cycle-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA4Q9BXL8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CDCA4Q9BXL8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDCA4Q9BXL8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDCA4Q9BXL8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDCA4Q9BXL8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CDCA4Q9BXL8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDCA4Q9BXL8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDCA4Q9BXL8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDCA4Q9BXL8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDCA4Q9BXL8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDCA4Q9BXL8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDCA4Q9BXL8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDCA4Q9BXL8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDCA4Q9BXL8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDCA4Q9BXL8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDCA4Q9BXL8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDCA4Q9BXL8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDCA4Q9BXL8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDCA4Q9BXL8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDCA4Q9BXL8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDCA4Q9BXL8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDCA4Q9BXL8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDCA4Q9BXL8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDCA4Q9BXL8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDCA4Q9BXL8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDCA4Q9BXL8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDCA4Q9BXL8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDCA4Q9BXL8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDCA4Q9BXL8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDCA4Q9BXL8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDCA4Q9BXL8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDCA4Q9BXL8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDCA4Q9BXL8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDCA4Q9BXL8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDCA4Q9BXL8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDCA4Q9BXL8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDCA4Q9BXL8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDCA4Q9BXL8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDCA4Q9BXL8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDCA4Q9BXL8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDCA4Q9BXL8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CDCA4Q9BXL8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CDCA4Q9BXL8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CDCA4Q9BXL8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDCA4Q9BXL8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDCA4Q9BXL8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDCA4Q9BXL8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDCA4Q9BXL8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDCA4Q9BXL8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDCA4Q9BXL8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDCA4Q9BXL8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDCA4Q9BXL8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CDCA4Q9BXL8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDCA4Q9BXL8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDCA4Q9BXL8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDCA4Q9BXL8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDCA4Q9BXL8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDCA4Q9BXL8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDCA4Q9BXL8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDCA4Q9BXL8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDCA4Q9BXL8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDCA4Q9BXL8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDCA4Q9BXL8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDCA4Q9BXL8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDCA4Q9BXL8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDCA4Q9BXL8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDCA4Q9BXL8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDCA4Q9BXL8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDCA4Q9BXL8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDCA4Q9BXL8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDCA4Q9BXL8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDCA4Q9BXL8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDCA4Q9BXL8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDCA4Q9BXL8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDCA4Q9BXL8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDCA4Q9BXL8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDCA4Q9BXL8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDCA4Q9BXL8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDCA4Q9BXL8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDCA4Q9BXL8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CDCA4Q9BXL8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDCA4Q9BXL8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDCA4Q9BXL8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDCA4Q9BXL8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDCA4Q9BXL8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDCA4Q9BXL8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDCA4Q9BXL8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDCA4Q9BXL8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDCA4Q9BXL8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDCA4Q9BXL8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDCA4Q9BXL8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CDCA4Q9BXL8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDCA4Q9BXL8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDCA4Q9BXL8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CDCA4Q9BXL8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDCA4Q9BXL8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDCA4Q9BXL8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDCA4Q9BXL8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDCA4Q9BXL8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDCA4Q9BXL8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms