Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF3

CECR2, Cat eye syndrome critical region protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CECR2Q9BXF3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC43.18■■■■■ 4.5
CECR2Q9BXF3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
CECR2Q9BXF3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC43.18■■■■■ 4.5
CECR2Q9BXF3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
CECR2Q9BXF3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.17■■■■■ 4.5
CECR2Q9BXF3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
CECR2Q9BXF3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
CECR2Q9BXF3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC43.17■■■■■ 4.5
CECR2Q9BXF3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC43.16■■■■■ 4.5
CECR2Q9BXF3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC43.16■■■■■ 4.5
CECR2Q9BXF3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
CECR2Q9BXF3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC43.15■■■■■ 4.5
CECR2Q9BXF3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
CECR2Q9BXF3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC43.14■■■■■ 4.5
CECR2Q9BXF3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC43.14■■■■■ 4.5
CECR2Q9BXF3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.5
CECR2Q9BXF3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.13■■■■■ 4.5
CECR2Q9BXF3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.5
CECR2Q9BXF3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC43.13■■■■■ 4.49
CECR2Q9BXF3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
CECR2Q9BXF3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC43.13■■■■■ 4.49
CECR2Q9BXF3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC43.13■■■■■ 4.49
CECR2Q9BXF3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC43.13■■■■■ 4.49
CECR2Q9BXF3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC43.13■■■■■ 4.49
CECR2Q9BXF3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC43.13■■■■■ 4.49
CECR2Q9BXF3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC43.12■■■■■ 4.49
CECR2Q9BXF3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
CECR2Q9BXF3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
CECR2Q9BXF3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC43.12■■■■■ 4.49
CECR2Q9BXF3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC43.12■■■■■ 4.49
CECR2Q9BXF3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.11■■■■■ 4.49
CECR2Q9BXF3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC43.1■■■■■ 4.49
CECR2Q9BXF3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
CECR2Q9BXF3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
CECR2Q9BXF3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC43.1■■■■■ 4.49
CECR2Q9BXF3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC43.1■■■■■ 4.49
CECR2Q9BXF3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
CECR2Q9BXF3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
CECR2Q9BXF3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC43.09■■■■■ 4.49
CECR2Q9BXF3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.09■■■■■ 4.49
CECR2Q9BXF3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC43.09■■■■■ 4.49
CECR2Q9BXF3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC43.09■■■■■ 4.49
CECR2Q9BXF3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.08■■■■■ 4.49
CECR2Q9BXF3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC43.08■■■■■ 4.49
CECR2Q9BXF3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.08■■■■■ 4.49
CECR2Q9BXF3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.08■■■■■ 4.49
CECR2Q9BXF3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
CECR2Q9BXF3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC43.07■■■■■ 4.49
CECR2Q9BXF3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
CECR2Q9BXF3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
CECR2Q9BXF3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC43.06■■■■■ 4.48
CECR2Q9BXF3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC43.06■■■■■ 4.48
CECR2Q9BXF3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC43.06■■■■■ 4.48
CECR2Q9BXF3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
CECR2Q9BXF3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
CECR2Q9BXF3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
CECR2Q9BXF3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
CECR2Q9BXF3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.06■■■■■ 4.48
CECR2Q9BXF3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC43.06■■■■■ 4.48
CECR2Q9BXF3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC43.06■■■■■ 4.48
CECR2Q9BXF3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC43.06■■■■■ 4.48
CECR2Q9BXF3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC43.05■■■■■ 4.48
CECR2Q9BXF3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
CECR2Q9BXF3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
CECR2Q9BXF3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.04■■■■■ 4.48
CECR2Q9BXF3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
CECR2Q9BXF3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC43.04■■■■■ 4.48
CECR2Q9BXF3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
CECR2Q9BXF3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.03■■■■■ 4.48
CECR2Q9BXF3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
CECR2Q9BXF3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
CECR2Q9BXF3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
CECR2Q9BXF3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
CECR2Q9BXF3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC43.02■■■■■ 4.48
CECR2Q9BXF3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
CECR2Q9BXF3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
CECR2Q9BXF3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC43.01■■■■■ 4.48
CECR2Q9BXF3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
CECR2Q9BXF3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC43.01■■■■■ 4.48
CECR2Q9BXF3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC43■■■■■ 4.47
CECR2Q9BXF3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
CECR2Q9BXF3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
CECR2Q9BXF3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC43■■■■■ 4.47
CECR2Q9BXF3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
CECR2Q9BXF3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
CECR2Q9BXF3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC42.99■■■■■ 4.47
CECR2Q9BXF3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC42.99■■■■■ 4.47
CECR2Q9BXF3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
CECR2Q9BXF3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
CECR2Q9BXF3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
CECR2Q9BXF3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.98■■■■■ 4.47
CECR2Q9BXF3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC42.98■■■■■ 4.47
CECR2Q9BXF3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC42.97■■■■■ 4.47
CECR2Q9BXF3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.97■■■■■ 4.47
CECR2Q9BXF3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
CECR2Q9BXF3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC42.96■■■■■ 4.47
CECR2Q9BXF3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC42.95■■■■■ 4.47
CECR2Q9BXF3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
CECR2Q9BXF3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.47
CECR2Q9BXF3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC42.94■■■■■ 4.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 368 ms