Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PLVAPQ9BX97 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PLVAPQ9BX97 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PLVAPQ9BX97 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PLVAPQ9BX97 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
PLVAPQ9BX97 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLVAPQ9BX97 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLVAPQ9BX97 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLVAPQ9BX97 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLVAPQ9BX97 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLVAPQ9BX97 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLVAPQ9BX97 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLVAPQ9BX97 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLVAPQ9BX97 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLVAPQ9BX97 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLVAPQ9BX97 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLVAPQ9BX97 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PLVAPQ9BX97 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PLVAPQ9BX97 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PLVAPQ9BX97 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PLVAPQ9BX97 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PLVAPQ9BX97 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PLVAPQ9BX97 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PLVAPQ9BX97 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PLVAPQ9BX97 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PLVAPQ9BX97 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLVAPQ9BX97 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLVAPQ9BX97 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PLVAPQ9BX97 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PLVAPQ9BX97 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLVAPQ9BX97 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLVAPQ9BX97 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLVAPQ9BX97 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLVAPQ9BX97 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PLVAPQ9BX97 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PLVAPQ9BX97 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PLVAPQ9BX97 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PLVAPQ9BX97 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PLVAPQ9BX97 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLVAPQ9BX97 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLVAPQ9BX97 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLVAPQ9BX97 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLVAPQ9BX97 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLVAPQ9BX97 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLVAPQ9BX97 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLVAPQ9BX97 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLVAPQ9BX97 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLVAPQ9BX97 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PLVAPQ9BX97 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLVAPQ9BX97 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PLVAPQ9BX97 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLVAPQ9BX97 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLVAPQ9BX97 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PLVAPQ9BX97 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PLVAPQ9BX97 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PLVAPQ9BX97 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLVAPQ9BX97 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLVAPQ9BX97 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLVAPQ9BX97 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLVAPQ9BX97 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLVAPQ9BX97 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLVAPQ9BX97 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLVAPQ9BX97 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLVAPQ9BX97 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLVAPQ9BX97 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLVAPQ9BX97 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLVAPQ9BX97 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PLVAPQ9BX97 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLVAPQ9BX97 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PLVAPQ9BX97 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLVAPQ9BX97 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLVAPQ9BX97 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PLVAPQ9BX97 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLVAPQ9BX97 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLVAPQ9BX97 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLVAPQ9BX97 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLVAPQ9BX97 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLVAPQ9BX97 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLVAPQ9BX97 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLVAPQ9BX97 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLVAPQ9BX97 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLVAPQ9BX97 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLVAPQ9BX97 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PLVAPQ9BX97 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLVAPQ9BX97 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLVAPQ9BX97 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLVAPQ9BX97 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLVAPQ9BX97 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLVAPQ9BX97 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLVAPQ9BX97 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLVAPQ9BX97 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLVAPQ9BX97 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLVAPQ9BX97 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLVAPQ9BX97 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLVAPQ9BX97 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLVAPQ9BX97 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLVAPQ9BX97 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLVAPQ9BX97 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLVAPQ9BX97 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLVAPQ9BX97 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms