Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BRIP1Q9BX63 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
BRIP1Q9BX63 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
BRIP1Q9BX63 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
BRIP1Q9BX63 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
BRIP1Q9BX63 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
BRIP1Q9BX63 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
BRIP1Q9BX63 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BRIP1Q9BX63 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BRIP1Q9BX63 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
BRIP1Q9BX63 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
BRIP1Q9BX63 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
BRIP1Q9BX63 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
BRIP1Q9BX63 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
BRIP1Q9BX63 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
BRIP1Q9BX63 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BRIP1Q9BX63 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
BRIP1Q9BX63 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BRIP1Q9BX63 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
BRIP1Q9BX63 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
BRIP1Q9BX63 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BRIP1Q9BX63 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BRIP1Q9BX63 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BRIP1Q9BX63 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BRIP1Q9BX63 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BRIP1Q9BX63 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BRIP1Q9BX63 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BRIP1Q9BX63 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRIP1Q9BX63 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRIP1Q9BX63 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
BRIP1Q9BX63 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRIP1Q9BX63 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRIP1Q9BX63 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRIP1Q9BX63 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRIP1Q9BX63 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRIP1Q9BX63 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRIP1Q9BX63 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
BRIP1Q9BX63 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRIP1Q9BX63 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRIP1Q9BX63 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRIP1Q9BX63 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRIP1Q9BX63 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRIP1Q9BX63 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
BRIP1Q9BX63 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRIP1Q9BX63 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRIP1Q9BX63 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRIP1Q9BX63 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRIP1Q9BX63 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRIP1Q9BX63 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRIP1Q9BX63 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRIP1Q9BX63 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRIP1Q9BX63 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BRIP1Q9BX63 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
BRIP1Q9BX63 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
BRIP1Q9BX63 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
BRIP1Q9BX63 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
BRIP1Q9BX63 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
BRIP1Q9BX63 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
BRIP1Q9BX63 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRIP1Q9BX63 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRIP1Q9BX63 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRIP1Q9BX63 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRIP1Q9BX63 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRIP1Q9BX63 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRIP1Q9BX63 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRIP1Q9BX63 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRIP1Q9BX63 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BRIP1Q9BX63 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BRIP1Q9BX63 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BRIP1Q9BX63 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRIP1Q9BX63 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRIP1Q9BX63 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRIP1Q9BX63 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRIP1Q9BX63 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
BRIP1Q9BX63 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRIP1Q9BX63 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
BRIP1Q9BX63 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
BRIP1Q9BX63 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
BRIP1Q9BX63 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
BRIP1Q9BX63 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
BRIP1Q9BX63 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BRIP1Q9BX63 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
BRIP1Q9BX63 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
BRIP1Q9BX63 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
BRIP1Q9BX63 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
BRIP1Q9BX63 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BRIP1Q9BX63 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BRIP1Q9BX63 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC29■■■□□ 2.23
BRIP1Q9BX63 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC29■■■□□ 2.23
BRIP1Q9BX63 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
BRIP1Q9BX63 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC29■■■□□ 2.23
BRIP1Q9BX63 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
BRIP1Q9BX63 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
BRIP1Q9BX63 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BRIP1Q9BX63 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
BRIP1Q9BX63 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
BRIP1Q9BX63 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
BRIP1Q9BX63 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BRIP1Q9BX63 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BRIP1Q9BX63 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187.3 ms