Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWS9

CHID1, Chitinase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHID1Q9BWS9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHID1Q9BWS9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHID1Q9BWS9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHID1Q9BWS9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHID1Q9BWS9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHID1Q9BWS9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHID1Q9BWS9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHID1Q9BWS9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHID1Q9BWS9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHID1Q9BWS9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHID1Q9BWS9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHID1Q9BWS9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHID1Q9BWS9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHID1Q9BWS9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHID1Q9BWS9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHID1Q9BWS9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHID1Q9BWS9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CHID1Q9BWS9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHID1Q9BWS9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHID1Q9BWS9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHID1Q9BWS9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHID1Q9BWS9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHID1Q9BWS9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHID1Q9BWS9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHID1Q9BWS9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHID1Q9BWS9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHID1Q9BWS9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHID1Q9BWS9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHID1Q9BWS9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHID1Q9BWS9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHID1Q9BWS9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHID1Q9BWS9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHID1Q9BWS9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHID1Q9BWS9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHID1Q9BWS9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHID1Q9BWS9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHID1Q9BWS9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHID1Q9BWS9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHID1Q9BWS9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHID1Q9BWS9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHID1Q9BWS9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHID1Q9BWS9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHID1Q9BWS9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHID1Q9BWS9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHID1Q9BWS9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHID1Q9BWS9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHID1Q9BWS9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHID1Q9BWS9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHID1Q9BWS9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHID1Q9BWS9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHID1Q9BWS9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHID1Q9BWS9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHID1Q9BWS9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHID1Q9BWS9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHID1Q9BWS9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHID1Q9BWS9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHID1Q9BWS9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHID1Q9BWS9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHID1Q9BWS9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHID1Q9BWS9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHID1Q9BWS9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHID1Q9BWS9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHID1Q9BWS9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHID1Q9BWS9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHID1Q9BWS9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHID1Q9BWS9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHID1Q9BWS9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHID1Q9BWS9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CHID1Q9BWS9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHID1Q9BWS9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHID1Q9BWS9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHID1Q9BWS9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CHID1Q9BWS9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHID1Q9BWS9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHID1Q9BWS9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHID1Q9BWS9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHID1Q9BWS9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHID1Q9BWS9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHID1Q9BWS9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHID1Q9BWS9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHID1Q9BWS9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHID1Q9BWS9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHID1Q9BWS9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHID1Q9BWS9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHID1Q9BWS9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CHID1Q9BWS9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHID1Q9BWS9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHID1Q9BWS9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHID1Q9BWS9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHID1Q9BWS9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CHID1Q9BWS9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHID1Q9BWS9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHID1Q9BWS9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHID1Q9BWS9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHID1Q9BWS9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHID1Q9BWS9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHID1Q9BWS9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHID1Q9BWS9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHID1Q9BWS9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHID1Q9BWS9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms