Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG6

SCNM1, Sodium channel modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNM1Q9BWG6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCNM1Q9BWG6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SCNM1Q9BWG6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCNM1Q9BWG6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCNM1Q9BWG6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCNM1Q9BWG6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCNM1Q9BWG6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SCNM1Q9BWG6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SCNM1Q9BWG6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCNM1Q9BWG6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCNM1Q9BWG6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCNM1Q9BWG6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCNM1Q9BWG6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCNM1Q9BWG6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCNM1Q9BWG6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCNM1Q9BWG6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCNM1Q9BWG6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCNM1Q9BWG6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCNM1Q9BWG6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCNM1Q9BWG6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCNM1Q9BWG6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCNM1Q9BWG6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCNM1Q9BWG6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCNM1Q9BWG6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SCNM1Q9BWG6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCNM1Q9BWG6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SCNM1Q9BWG6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SCNM1Q9BWG6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCNM1Q9BWG6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SCNM1Q9BWG6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SCNM1Q9BWG6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SCNM1Q9BWG6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SCNM1Q9BWG6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SCNM1Q9BWG6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SCNM1Q9BWG6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SCNM1Q9BWG6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCNM1Q9BWG6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCNM1Q9BWG6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCNM1Q9BWG6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCNM1Q9BWG6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCNM1Q9BWG6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCNM1Q9BWG6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCNM1Q9BWG6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCNM1Q9BWG6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCNM1Q9BWG6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCNM1Q9BWG6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SCNM1Q9BWG6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCNM1Q9BWG6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCNM1Q9BWG6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCNM1Q9BWG6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCNM1Q9BWG6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCNM1Q9BWG6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCNM1Q9BWG6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCNM1Q9BWG6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCNM1Q9BWG6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCNM1Q9BWG6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCNM1Q9BWG6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCNM1Q9BWG6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SCNM1Q9BWG6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCNM1Q9BWG6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCNM1Q9BWG6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCNM1Q9BWG6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCNM1Q9BWG6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCNM1Q9BWG6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCNM1Q9BWG6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCNM1Q9BWG6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCNM1Q9BWG6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCNM1Q9BWG6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCNM1Q9BWG6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCNM1Q9BWG6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCNM1Q9BWG6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCNM1Q9BWG6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCNM1Q9BWG6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCNM1Q9BWG6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SCNM1Q9BWG6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCNM1Q9BWG6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCNM1Q9BWG6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCNM1Q9BWG6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCNM1Q9BWG6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCNM1Q9BWG6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCNM1Q9BWG6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCNM1Q9BWG6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCNM1Q9BWG6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCNM1Q9BWG6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCNM1Q9BWG6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCNM1Q9BWG6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SCNM1Q9BWG6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCNM1Q9BWG6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCNM1Q9BWG6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCNM1Q9BWG6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCNM1Q9BWG6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCNM1Q9BWG6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCNM1Q9BWG6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCNM1Q9BWG6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCNM1Q9BWG6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCNM1Q9BWG6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SCNM1Q9BWG6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCNM1Q9BWG6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCNM1Q9BWG6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCNM1Q9BWG6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms