Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MESP1Q9BRJ9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MESP1Q9BRJ9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MESP1Q9BRJ9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MESP1Q9BRJ9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MESP1Q9BRJ9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MESP1Q9BRJ9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MESP1Q9BRJ9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MESP1Q9BRJ9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MESP1Q9BRJ9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MESP1Q9BRJ9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MESP1Q9BRJ9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MESP1Q9BRJ9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MESP1Q9BRJ9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MESP1Q9BRJ9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MESP1Q9BRJ9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MESP1Q9BRJ9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MESP1Q9BRJ9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MESP1Q9BRJ9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MESP1Q9BRJ9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MESP1Q9BRJ9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MESP1Q9BRJ9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MESP1Q9BRJ9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MESP1Q9BRJ9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MESP1Q9BRJ9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MESP1Q9BRJ9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MESP1Q9BRJ9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MESP1Q9BRJ9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MESP1Q9BRJ9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MESP1Q9BRJ9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MESP1Q9BRJ9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MESP1Q9BRJ9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MESP1Q9BRJ9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MESP1Q9BRJ9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MESP1Q9BRJ9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MESP1Q9BRJ9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MESP1Q9BRJ9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MESP1Q9BRJ9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MESP1Q9BRJ9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MESP1Q9BRJ9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MESP1Q9BRJ9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MESP1Q9BRJ9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MESP1Q9BRJ9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MESP1Q9BRJ9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MESP1Q9BRJ9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MESP1Q9BRJ9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MESP1Q9BRJ9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MESP1Q9BRJ9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MESP1Q9BRJ9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MESP1Q9BRJ9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MESP1Q9BRJ9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MESP1Q9BRJ9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MESP1Q9BRJ9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MESP1Q9BRJ9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MESP1Q9BRJ9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MESP1Q9BRJ9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MESP1Q9BRJ9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MESP1Q9BRJ9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MESP1Q9BRJ9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MESP1Q9BRJ9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MESP1Q9BRJ9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MESP1Q9BRJ9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MESP1Q9BRJ9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MESP1Q9BRJ9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MESP1Q9BRJ9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MESP1Q9BRJ9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MESP1Q9BRJ9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MESP1Q9BRJ9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MESP1Q9BRJ9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MESP1Q9BRJ9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MESP1Q9BRJ9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MESP1Q9BRJ9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MESP1Q9BRJ9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MESP1Q9BRJ9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MESP1Q9BRJ9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MESP1Q9BRJ9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MESP1Q9BRJ9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MESP1Q9BRJ9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MESP1Q9BRJ9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MESP1Q9BRJ9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MESP1Q9BRJ9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MESP1Q9BRJ9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MESP1Q9BRJ9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MESP1Q9BRJ9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MESP1Q9BRJ9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MESP1Q9BRJ9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MESP1Q9BRJ9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MESP1Q9BRJ9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
MESP1Q9BRJ9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
MESP1Q9BRJ9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MESP1Q9BRJ9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MESP1Q9BRJ9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MESP1Q9BRJ9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MESP1Q9BRJ9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MESP1Q9BRJ9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MESP1Q9BRJ9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MESP1Q9BRJ9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms