Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ39

DDX50, ATP-dependent RNA helicase DDX50, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX50Q9BQ39 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX50Q9BQ39 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX50Q9BQ39 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX50Q9BQ39 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX50Q9BQ39 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX50Q9BQ39 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX50Q9BQ39 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX50Q9BQ39 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX50Q9BQ39 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX50Q9BQ39 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX50Q9BQ39 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX50Q9BQ39 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX50Q9BQ39 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX50Q9BQ39 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX50Q9BQ39 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX50Q9BQ39 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX50Q9BQ39 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX50Q9BQ39 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX50Q9BQ39 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX50Q9BQ39 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX50Q9BQ39 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX50Q9BQ39 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDX50Q9BQ39 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX50Q9BQ39 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX50Q9BQ39 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX50Q9BQ39 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDX50Q9BQ39 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DDX50Q9BQ39 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
DDX50Q9BQ39 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX50Q9BQ39 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX50Q9BQ39 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX50Q9BQ39 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX50Q9BQ39 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX50Q9BQ39 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX50Q9BQ39 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX50Q9BQ39 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX50Q9BQ39 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX50Q9BQ39 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX50Q9BQ39 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX50Q9BQ39 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX50Q9BQ39 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX50Q9BQ39 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX50Q9BQ39 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX50Q9BQ39 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX50Q9BQ39 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX50Q9BQ39 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX50Q9BQ39 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX50Q9BQ39 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX50Q9BQ39 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX50Q9BQ39 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX50Q9BQ39 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX50Q9BQ39 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX50Q9BQ39 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX50Q9BQ39 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX50Q9BQ39 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX50Q9BQ39 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX50Q9BQ39 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX50Q9BQ39 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX50Q9BQ39 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX50Q9BQ39 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX50Q9BQ39 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX50Q9BQ39 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX50Q9BQ39 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX50Q9BQ39 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX50Q9BQ39 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX50Q9BQ39 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX50Q9BQ39 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX50Q9BQ39 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX50Q9BQ39 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX50Q9BQ39 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX50Q9BQ39 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX50Q9BQ39 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX50Q9BQ39 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX50Q9BQ39 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX50Q9BQ39 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX50Q9BQ39 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX50Q9BQ39 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX50Q9BQ39 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX50Q9BQ39 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX50Q9BQ39 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX50Q9BQ39 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX50Q9BQ39 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX50Q9BQ39 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX50Q9BQ39 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX50Q9BQ39 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX50Q9BQ39 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX50Q9BQ39 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX50Q9BQ39 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX50Q9BQ39 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX50Q9BQ39 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DDX50Q9BQ39 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX50Q9BQ39 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX50Q9BQ39 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24■■□□□ 1.43
DDX50Q9BQ39 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24■■□□□ 1.43
DDX50Q9BQ39 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24■■□□□ 1.43
DDX50Q9BQ39 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DDX50Q9BQ39 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DDX50Q9BQ39 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX50Q9BQ39 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX50Q9BQ39 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms