Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNS3Q9BQ31 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNS3Q9BQ31 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNS3Q9BQ31 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNS3Q9BQ31 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNS3Q9BQ31 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNS3Q9BQ31 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNS3Q9BQ31 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNS3Q9BQ31 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNS3Q9BQ31 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNS3Q9BQ31 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNS3Q9BQ31 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNS3Q9BQ31 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNS3Q9BQ31 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNS3Q9BQ31 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNS3Q9BQ31 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNS3Q9BQ31 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNS3Q9BQ31 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNS3Q9BQ31 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNS3Q9BQ31 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNS3Q9BQ31 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNS3Q9BQ31 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNS3Q9BQ31 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNS3Q9BQ31 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNS3Q9BQ31 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNS3Q9BQ31 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNS3Q9BQ31 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNS3Q9BQ31 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNS3Q9BQ31 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNS3Q9BQ31 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNS3Q9BQ31 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNS3Q9BQ31 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNS3Q9BQ31 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms