Protein–RNA interactions for Protein: Q99990

VGLL1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL1Q99990 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
VGLL1Q99990 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VGLL1Q99990 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VGLL1Q99990 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VGLL1Q99990 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VGLL1Q99990 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VGLL1Q99990 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VGLL1Q99990 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VGLL1Q99990 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VGLL1Q99990 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VGLL1Q99990 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VGLL1Q99990 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
VGLL1Q99990 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VGLL1Q99990 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VGLL1Q99990 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VGLL1Q99990 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VGLL1Q99990 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VGLL1Q99990 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VGLL1Q99990 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VGLL1Q99990 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
VGLL1Q99990 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VGLL1Q99990 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
VGLL1Q99990 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
VGLL1Q99990 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VGLL1Q99990 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VGLL1Q99990 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VGLL1Q99990 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VGLL1Q99990 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VGLL1Q99990 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VGLL1Q99990 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VGLL1Q99990 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VGLL1Q99990 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VGLL1Q99990 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VGLL1Q99990 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VGLL1Q99990 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VGLL1Q99990 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VGLL1Q99990 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VGLL1Q99990 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VGLL1Q99990 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
VGLL1Q99990 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VGLL1Q99990 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VGLL1Q99990 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VGLL1Q99990 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VGLL1Q99990 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VGLL1Q99990 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VGLL1Q99990 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VGLL1Q99990 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VGLL1Q99990 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VGLL1Q99990 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VGLL1Q99990 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VGLL1Q99990 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VGLL1Q99990 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VGLL1Q99990 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VGLL1Q99990 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VGLL1Q99990 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VGLL1Q99990 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VGLL1Q99990 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VGLL1Q99990 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VGLL1Q99990 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VGLL1Q99990 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VGLL1Q99990 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VGLL1Q99990 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VGLL1Q99990 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VGLL1Q99990 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VGLL1Q99990 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VGLL1Q99990 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VGLL1Q99990 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VGLL1Q99990 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VGLL1Q99990 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VGLL1Q99990 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VGLL1Q99990 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VGLL1Q99990 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VGLL1Q99990 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VGLL1Q99990 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VGLL1Q99990 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VGLL1Q99990 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VGLL1Q99990 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VGLL1Q99990 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VGLL1Q99990 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VGLL1Q99990 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VGLL1Q99990 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VGLL1Q99990 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VGLL1Q99990 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
VGLL1Q99990 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
VGLL1Q99990 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VGLL1Q99990 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VGLL1Q99990 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VGLL1Q99990 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VGLL1Q99990 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VGLL1Q99990 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VGLL1Q99990 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VGLL1Q99990 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VGLL1Q99990 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VGLL1Q99990 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VGLL1Q99990 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VGLL1Q99990 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VGLL1Q99990 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VGLL1Q99990 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VGLL1Q99990 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VGLL1Q99990 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms