Protein–RNA interactions for Protein: Q99805

TM9SF2, Transmembrane 9 superfamily member 2, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF2Q99805 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TM9SF2Q99805 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TM9SF2Q99805 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TM9SF2Q99805 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TM9SF2Q99805 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TM9SF2Q99805 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TM9SF2Q99805 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TM9SF2Q99805 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TM9SF2Q99805 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TM9SF2Q99805 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TM9SF2Q99805 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TM9SF2Q99805 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TM9SF2Q99805 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TM9SF2Q99805 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TM9SF2Q99805 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TM9SF2Q99805 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TM9SF2Q99805 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TM9SF2Q99805 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TM9SF2Q99805 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TM9SF2Q99805 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TM9SF2Q99805 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TM9SF2Q99805 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TM9SF2Q99805 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TM9SF2Q99805 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TM9SF2Q99805 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TM9SF2Q99805 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TM9SF2Q99805 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TM9SF2Q99805 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TM9SF2Q99805 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TM9SF2Q99805 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TM9SF2Q99805 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TM9SF2Q99805 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TM9SF2Q99805 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TM9SF2Q99805 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TM9SF2Q99805 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TM9SF2Q99805 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TM9SF2Q99805 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TM9SF2Q99805 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TM9SF2Q99805 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TM9SF2Q99805 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TM9SF2Q99805 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TM9SF2Q99805 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TM9SF2Q99805 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TM9SF2Q99805 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TM9SF2Q99805 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TM9SF2Q99805 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TM9SF2Q99805 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TM9SF2Q99805 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TM9SF2Q99805 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TM9SF2Q99805 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TM9SF2Q99805 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TM9SF2Q99805 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TM9SF2Q99805 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TM9SF2Q99805 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TM9SF2Q99805 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TM9SF2Q99805 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TM9SF2Q99805 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TM9SF2Q99805 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TM9SF2Q99805 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TM9SF2Q99805 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TM9SF2Q99805 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TM9SF2Q99805 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TM9SF2Q99805 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TM9SF2Q99805 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TM9SF2Q99805 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TM9SF2Q99805 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TM9SF2Q99805 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TM9SF2Q99805 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TM9SF2Q99805 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TM9SF2Q99805 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TM9SF2Q99805 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TM9SF2Q99805 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TM9SF2Q99805 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TM9SF2Q99805 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TM9SF2Q99805 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TM9SF2Q99805 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TM9SF2Q99805 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TM9SF2Q99805 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TM9SF2Q99805 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TM9SF2Q99805 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TM9SF2Q99805 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TM9SF2Q99805 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TM9SF2Q99805 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TM9SF2Q99805 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TM9SF2Q99805 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TM9SF2Q99805 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TM9SF2Q99805 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TM9SF2Q99805 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TM9SF2Q99805 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TM9SF2Q99805 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TM9SF2Q99805 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TM9SF2Q99805 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TM9SF2Q99805 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TM9SF2Q99805 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TM9SF2Q99805 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TM9SF2Q99805 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TM9SF2Q99805 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TM9SF2Q99805 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TM9SF2Q99805 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TM9SF2Q99805 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms