Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBBP8Q99708 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBBP8Q99708 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBBP8Q99708 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RBBP8Q99708 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBBP8Q99708 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBBP8Q99708 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBBP8Q99708 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBBP8Q99708 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBBP8Q99708 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBBP8Q99708 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBBP8Q99708 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBBP8Q99708 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBBP8Q99708 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBBP8Q99708 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBBP8Q99708 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBBP8Q99708 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBBP8Q99708 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBBP8Q99708 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBBP8Q99708 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBBP8Q99708 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RBBP8Q99708 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBBP8Q99708 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBBP8Q99708 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBBP8Q99708 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBBP8Q99708 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBBP8Q99708 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBBP8Q99708 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBBP8Q99708 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBBP8Q99708 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RBBP8Q99708 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBBP8Q99708 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RBBP8Q99708 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBBP8Q99708 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBBP8Q99708 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBBP8Q99708 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBBP8Q99708 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBBP8Q99708 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBBP8Q99708 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RBBP8Q99708 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RBBP8Q99708 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RBBP8Q99708 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RBBP8Q99708 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBBP8Q99708 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBBP8Q99708 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBBP8Q99708 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RBBP8Q99708 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RBBP8Q99708 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBBP8Q99708 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBBP8Q99708 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBBP8Q99708 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBBP8Q99708 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBBP8Q99708 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBBP8Q99708 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RBBP8Q99708 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBBP8Q99708 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBBP8Q99708 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBBP8Q99708 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBBP8Q99708 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBBP8Q99708 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBBP8Q99708 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RBBP8Q99708 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBBP8Q99708 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBBP8Q99708 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBBP8Q99708 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBBP8Q99708 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBBP8Q99708 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBBP8Q99708 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBBP8Q99708 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBBP8Q99708 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBBP8Q99708 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBBP8Q99708 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RBBP8Q99708 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RBBP8Q99708 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBBP8Q99708 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBBP8Q99708 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBBP8Q99708 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBBP8Q99708 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBBP8Q99708 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBBP8Q99708 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBBP8Q99708 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RBBP8Q99708 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBBP8Q99708 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBBP8Q99708 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBBP8Q99708 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBBP8Q99708 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBBP8Q99708 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBBP8Q99708 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBBP8Q99708 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBBP8Q99708 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBBP8Q99708 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBBP8Q99708 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RBBP8Q99708 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBBP8Q99708 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBBP8Q99708 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBBP8Q99708 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBBP8Q99708 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RBBP8Q99708 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBBP8Q99708 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBBP8Q99708 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms