Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PIK3R4Q99570 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PIK3R4Q99570 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PIK3R4Q99570 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PIK3R4Q99570 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PIK3R4Q99570 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
PIK3R4Q99570 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
PIK3R4Q99570 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
PIK3R4Q99570 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PIK3R4Q99570 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PIK3R4Q99570 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PIK3R4Q99570 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PIK3R4Q99570 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PIK3R4Q99570 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
PIK3R4Q99570 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
PIK3R4Q99570 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PIK3R4Q99570 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
PIK3R4Q99570 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC33■■■□□ 2.87
PIK3R4Q99570 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PIK3R4Q99570 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PIK3R4Q99570 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PIK3R4Q99570 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PIK3R4Q99570 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PIK3R4Q99570 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PIK3R4Q99570 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PIK3R4Q99570 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PIK3R4Q99570 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
PIK3R4Q99570 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PIK3R4Q99570 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PIK3R4Q99570 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PIK3R4Q99570 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PIK3R4Q99570 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PIK3R4Q99570 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
PIK3R4Q99570 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PIK3R4Q99570 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PIK3R4Q99570 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PIK3R4Q99570 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PIK3R4Q99570 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
PIK3R4Q99570 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PIK3R4Q99570 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PIK3R4Q99570 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PIK3R4Q99570 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PIK3R4Q99570 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PIK3R4Q99570 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PIK3R4Q99570 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PIK3R4Q99570 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PIK3R4Q99570 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PIK3R4Q99570 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PIK3R4Q99570 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PIK3R4Q99570 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PIK3R4Q99570 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PIK3R4Q99570 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PIK3R4Q99570 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PIK3R4Q99570 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PIK3R4Q99570 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PIK3R4Q99570 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PIK3R4Q99570 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
PIK3R4Q99570 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PIK3R4Q99570 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
PIK3R4Q99570 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PIK3R4Q99570 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PIK3R4Q99570 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PIK3R4Q99570 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
PIK3R4Q99570 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PIK3R4Q99570 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PIK3R4Q99570 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PIK3R4Q99570 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PIK3R4Q99570 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PIK3R4Q99570 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PIK3R4Q99570 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PIK3R4Q99570 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PIK3R4Q99570 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PIK3R4Q99570 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
PIK3R4Q99570 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PIK3R4Q99570 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PIK3R4Q99570 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PIK3R4Q99570 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PIK3R4Q99570 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PIK3R4Q99570 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PIK3R4Q99570 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PIK3R4Q99570 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PIK3R4Q99570 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PIK3R4Q99570 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PIK3R4Q99570 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PIK3R4Q99570 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PIK3R4Q99570 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PIK3R4Q99570 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PIK3R4Q99570 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PIK3R4Q99570 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PIK3R4Q99570 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PIK3R4Q99570 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PIK3R4Q99570 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PIK3R4Q99570 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PIK3R4Q99570 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PIK3R4Q99570 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PIK3R4Q99570 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PIK3R4Q99570 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PIK3R4Q99570 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PIK3R4Q99570 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
PIK3R4Q99570 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms