Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB4

SRPK1, SRSF protein kinase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPK1Q96SB4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRPK1Q96SB4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRPK1Q96SB4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRPK1Q96SB4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRPK1Q96SB4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRPK1Q96SB4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRPK1Q96SB4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRPK1Q96SB4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRPK1Q96SB4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRPK1Q96SB4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRPK1Q96SB4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRPK1Q96SB4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRPK1Q96SB4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRPK1Q96SB4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRPK1Q96SB4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SRPK1Q96SB4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SRPK1Q96SB4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRPK1Q96SB4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRPK1Q96SB4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRPK1Q96SB4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRPK1Q96SB4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRPK1Q96SB4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRPK1Q96SB4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRPK1Q96SB4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SRPK1Q96SB4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SRPK1Q96SB4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SRPK1Q96SB4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SRPK1Q96SB4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SRPK1Q96SB4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRPK1Q96SB4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRPK1Q96SB4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRPK1Q96SB4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRPK1Q96SB4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRPK1Q96SB4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRPK1Q96SB4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRPK1Q96SB4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRPK1Q96SB4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRPK1Q96SB4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRPK1Q96SB4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRPK1Q96SB4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRPK1Q96SB4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRPK1Q96SB4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRPK1Q96SB4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRPK1Q96SB4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRPK1Q96SB4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRPK1Q96SB4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRPK1Q96SB4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRPK1Q96SB4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRPK1Q96SB4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRPK1Q96SB4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRPK1Q96SB4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRPK1Q96SB4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRPK1Q96SB4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SRPK1Q96SB4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRPK1Q96SB4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRPK1Q96SB4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRPK1Q96SB4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRPK1Q96SB4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRPK1Q96SB4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRPK1Q96SB4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRPK1Q96SB4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRPK1Q96SB4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRPK1Q96SB4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SRPK1Q96SB4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRPK1Q96SB4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRPK1Q96SB4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRPK1Q96SB4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRPK1Q96SB4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRPK1Q96SB4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRPK1Q96SB4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRPK1Q96SB4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRPK1Q96SB4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRPK1Q96SB4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRPK1Q96SB4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRPK1Q96SB4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRPK1Q96SB4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRPK1Q96SB4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRPK1Q96SB4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRPK1Q96SB4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRPK1Q96SB4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SRPK1Q96SB4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SRPK1Q96SB4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRPK1Q96SB4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRPK1Q96SB4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRPK1Q96SB4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRPK1Q96SB4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRPK1Q96SB4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRPK1Q96SB4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRPK1Q96SB4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SRPK1Q96SB4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SRPK1Q96SB4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SRPK1Q96SB4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SRPK1Q96SB4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRPK1Q96SB4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRPK1Q96SB4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRPK1Q96SB4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRPK1Q96SB4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRPK1Q96SB4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRPK1Q96SB4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRPK1Q96SB4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms