Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
LMTK3Q96Q04 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
LMTK3Q96Q04 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
LMTK3Q96Q04 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
LMTK3Q96Q04 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
LMTK3Q96Q04 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
LMTK3Q96Q04 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.06
LMTK3Q96Q04 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
LMTK3Q96Q04 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
LMTK3Q96Q04 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
LMTK3Q96Q04 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC34.18■■■■□ 3.06
LMTK3Q96Q04 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
LMTK3Q96Q04 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
LMTK3Q96Q04 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
LMTK3Q96Q04 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
LMTK3Q96Q04 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
LMTK3Q96Q04 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
LMTK3Q96Q04 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
LMTK3Q96Q04 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
LMTK3Q96Q04 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
LMTK3Q96Q04 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
LMTK3Q96Q04 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
LMTK3Q96Q04 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
LMTK3Q96Q04 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
LMTK3Q96Q04 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
LMTK3Q96Q04 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
LMTK3Q96Q04 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
LMTK3Q96Q04 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
LMTK3Q96Q04 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
LMTK3Q96Q04 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC34.14■■■■□ 3.06
LMTK3Q96Q04 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
LMTK3Q96Q04 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.05
LMTK3Q96Q04 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
LMTK3Q96Q04 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
LMTK3Q96Q04 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
LMTK3Q96Q04 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
LMTK3Q96Q04 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
LMTK3Q96Q04 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
LMTK3Q96Q04 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
LMTK3Q96Q04 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
LMTK3Q96Q04 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
LMTK3Q96Q04 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
LMTK3Q96Q04 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
LMTK3Q96Q04 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
LMTK3Q96Q04 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
LMTK3Q96Q04 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC34.1■■■■□ 3.05
LMTK3Q96Q04 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
LMTK3Q96Q04 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
LMTK3Q96Q04 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
LMTK3Q96Q04 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
LMTK3Q96Q04 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
LMTK3Q96Q04 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
LMTK3Q96Q04 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
LMTK3Q96Q04 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
LMTK3Q96Q04 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
LMTK3Q96Q04 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
LMTK3Q96Q04 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
LMTK3Q96Q04 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
LMTK3Q96Q04 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
LMTK3Q96Q04 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
LMTK3Q96Q04 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
LMTK3Q96Q04 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
LMTK3Q96Q04 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
LMTK3Q96Q04 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
LMTK3Q96Q04 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
LMTK3Q96Q04 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
LMTK3Q96Q04 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
LMTK3Q96Q04 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
LMTK3Q96Q04 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
LMTK3Q96Q04 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
LMTK3Q96Q04 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
LMTK3Q96Q04 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
LMTK3Q96Q04 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
LMTK3Q96Q04 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC34.06■■■■□ 3.04
LMTK3Q96Q04 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
LMTK3Q96Q04 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
LMTK3Q96Q04 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
LMTK3Q96Q04 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
LMTK3Q96Q04 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
LMTK3Q96Q04 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
LMTK3Q96Q04 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
LMTK3Q96Q04 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
LMTK3Q96Q04 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
LMTK3Q96Q04 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
LMTK3Q96Q04 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
LMTK3Q96Q04 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
LMTK3Q96Q04 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
LMTK3Q96Q04 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
LMTK3Q96Q04 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
LMTK3Q96Q04 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
LMTK3Q96Q04 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
LMTK3Q96Q04 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
LMTK3Q96Q04 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
LMTK3Q96Q04 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
LMTK3Q96Q04 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
LMTK3Q96Q04 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
LMTK3Q96Q04 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
LMTK3Q96Q04 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
LMTK3Q96Q04 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
LMTK3Q96Q04 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms