Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NLRP3Q96P20 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NLRP3Q96P20 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NLRP3Q96P20 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NLRP3Q96P20 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NLRP3Q96P20 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NLRP3Q96P20 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NLRP3Q96P20 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NLRP3Q96P20 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NLRP3Q96P20 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NLRP3Q96P20 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NLRP3Q96P20 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
NLRP3Q96P20 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NLRP3Q96P20 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NLRP3Q96P20 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NLRP3Q96P20 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
NLRP3Q96P20 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NLRP3Q96P20 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NLRP3Q96P20 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NLRP3Q96P20 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NLRP3Q96P20 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
NLRP3Q96P20 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NLRP3Q96P20 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NLRP3Q96P20 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NLRP3Q96P20 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NLRP3Q96P20 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NLRP3Q96P20 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NLRP3Q96P20 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
NLRP3Q96P20 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NLRP3Q96P20 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NLRP3Q96P20 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NLRP3Q96P20 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NLRP3Q96P20 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NLRP3Q96P20 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NLRP3Q96P20 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NLRP3Q96P20 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NLRP3Q96P20 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NLRP3Q96P20 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NLRP3Q96P20 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NLRP3Q96P20 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NLRP3Q96P20 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
NLRP3Q96P20 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NLRP3Q96P20 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NLRP3Q96P20 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NLRP3Q96P20 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NLRP3Q96P20 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
NLRP3Q96P20 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NLRP3Q96P20 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NLRP3Q96P20 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NLRP3Q96P20 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NLRP3Q96P20 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NLRP3Q96P20 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NLRP3Q96P20 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NLRP3Q96P20 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NLRP3Q96P20 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
NLRP3Q96P20 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NLRP3Q96P20 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NLRP3Q96P20 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NLRP3Q96P20 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NLRP3Q96P20 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
NLRP3Q96P20 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NLRP3Q96P20 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NLRP3Q96P20 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NLRP3Q96P20 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NLRP3Q96P20 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NLRP3Q96P20 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NLRP3Q96P20 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NLRP3Q96P20 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NLRP3Q96P20 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NLRP3Q96P20 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NLRP3Q96P20 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
NLRP3Q96P20 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NLRP3Q96P20 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NLRP3Q96P20 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NLRP3Q96P20 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NLRP3Q96P20 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NLRP3Q96P20 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NLRP3Q96P20 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NLRP3Q96P20 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NLRP3Q96P20 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NLRP3Q96P20 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NLRP3Q96P20 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NLRP3Q96P20 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NLRP3Q96P20 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NLRP3Q96P20 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NLRP3Q96P20 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NLRP3Q96P20 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NLRP3Q96P20 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NLRP3Q96P20 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NLRP3Q96P20 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NLRP3Q96P20 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NLRP3Q96P20 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NLRP3Q96P20 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NLRP3Q96P20 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NLRP3Q96P20 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NLRP3Q96P20 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NLRP3Q96P20 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NLRP3Q96P20 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NLRP3Q96P20 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NLRP3Q96P20 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms