Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW7

LRRC7, Leucine-rich repeat-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC7Q96NW7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
LRRC7Q96NW7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
LRRC7Q96NW7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
LRRC7Q96NW7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
LRRC7Q96NW7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
LRRC7Q96NW7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
LRRC7Q96NW7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
LRRC7Q96NW7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
LRRC7Q96NW7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
LRRC7Q96NW7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
LRRC7Q96NW7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
LRRC7Q96NW7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
LRRC7Q96NW7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
LRRC7Q96NW7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
LRRC7Q96NW7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
LRRC7Q96NW7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC33.09■■■□□ 2.89
LRRC7Q96NW7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
LRRC7Q96NW7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
LRRC7Q96NW7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
LRRC7Q96NW7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
LRRC7Q96NW7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
LRRC7Q96NW7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
LRRC7Q96NW7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
LRRC7Q96NW7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
LRRC7Q96NW7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
LRRC7Q96NW7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
LRRC7Q96NW7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
LRRC7Q96NW7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
LRRC7Q96NW7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
LRRC7Q96NW7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
LRRC7Q96NW7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
LRRC7Q96NW7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
LRRC7Q96NW7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
LRRC7Q96NW7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
LRRC7Q96NW7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
LRRC7Q96NW7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
LRRC7Q96NW7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
LRRC7Q96NW7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
LRRC7Q96NW7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
LRRC7Q96NW7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
LRRC7Q96NW7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
LRRC7Q96NW7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
LRRC7Q96NW7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
LRRC7Q96NW7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
LRRC7Q96NW7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
LRRC7Q96NW7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
LRRC7Q96NW7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
LRRC7Q96NW7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
LRRC7Q96NW7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
LRRC7Q96NW7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
LRRC7Q96NW7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
LRRC7Q96NW7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
LRRC7Q96NW7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
LRRC7Q96NW7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
LRRC7Q96NW7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
LRRC7Q96NW7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
LRRC7Q96NW7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
LRRC7Q96NW7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
LRRC7Q96NW7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
LRRC7Q96NW7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
LRRC7Q96NW7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
LRRC7Q96NW7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
LRRC7Q96NW7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
LRRC7Q96NW7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
LRRC7Q96NW7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
LRRC7Q96NW7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
LRRC7Q96NW7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
LRRC7Q96NW7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
LRRC7Q96NW7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
LRRC7Q96NW7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
LRRC7Q96NW7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
LRRC7Q96NW7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
LRRC7Q96NW7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
LRRC7Q96NW7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
LRRC7Q96NW7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
LRRC7Q96NW7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
LRRC7Q96NW7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
LRRC7Q96NW7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
LRRC7Q96NW7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
LRRC7Q96NW7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
LRRC7Q96NW7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
LRRC7Q96NW7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
LRRC7Q96NW7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
LRRC7Q96NW7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
LRRC7Q96NW7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
LRRC7Q96NW7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
LRRC7Q96NW7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
LRRC7Q96NW7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
LRRC7Q96NW7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
LRRC7Q96NW7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
LRRC7Q96NW7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
LRRC7Q96NW7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
LRRC7Q96NW7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
LRRC7Q96NW7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
LRRC7Q96NW7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
LRRC7Q96NW7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
LRRC7Q96NW7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
LRRC7Q96NW7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
LRRC7Q96NW7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
LRRC7Q96NW7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms