Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT0

CCDC115, Coiled-coil domain-containing protein 115, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC115Q96NT0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC115Q96NT0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC115Q96NT0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC115Q96NT0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC115Q96NT0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC115Q96NT0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC115Q96NT0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC115Q96NT0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC115Q96NT0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC115Q96NT0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC115Q96NT0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC115Q96NT0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC115Q96NT0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC115Q96NT0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC115Q96NT0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC115Q96NT0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC115Q96NT0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC115Q96NT0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC115Q96NT0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC115Q96NT0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC115Q96NT0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC115Q96NT0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC115Q96NT0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC115Q96NT0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC115Q96NT0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC115Q96NT0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC115Q96NT0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC115Q96NT0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC115Q96NT0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC115Q96NT0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC115Q96NT0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC115Q96NT0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC115Q96NT0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC115Q96NT0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC115Q96NT0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC115Q96NT0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC115Q96NT0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC115Q96NT0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC115Q96NT0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC115Q96NT0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC115Q96NT0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC115Q96NT0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC115Q96NT0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC115Q96NT0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC115Q96NT0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC115Q96NT0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC115Q96NT0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC115Q96NT0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC115Q96NT0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC115Q96NT0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC115Q96NT0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC115Q96NT0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC115Q96NT0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC115Q96NT0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC115Q96NT0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC115Q96NT0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC115Q96NT0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC115Q96NT0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC115Q96NT0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC115Q96NT0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC115Q96NT0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC115Q96NT0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC115Q96NT0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC115Q96NT0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC115Q96NT0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC115Q96NT0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC115Q96NT0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC115Q96NT0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC115Q96NT0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC115Q96NT0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC115Q96NT0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC115Q96NT0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC115Q96NT0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC115Q96NT0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC115Q96NT0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC115Q96NT0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC115Q96NT0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC115Q96NT0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC115Q96NT0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC115Q96NT0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC115Q96NT0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC115Q96NT0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC115Q96NT0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC115Q96NT0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC115Q96NT0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC115Q96NT0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC115Q96NT0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC115Q96NT0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC115Q96NT0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC115Q96NT0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC115Q96NT0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC115Q96NT0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC115Q96NT0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC115Q96NT0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC115Q96NT0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC115Q96NT0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC115Q96NT0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC115Q96NT0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC115Q96NT0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC115Q96NT0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms