Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
FAM20AQ96MK3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FAM20AQ96MK3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FAM20AQ96MK3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
FAM20AQ96MK3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
FAM20AQ96MK3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FAM20AQ96MK3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FAM20AQ96MK3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FAM20AQ96MK3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FAM20AQ96MK3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FAM20AQ96MK3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FAM20AQ96MK3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FAM20AQ96MK3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FAM20AQ96MK3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FAM20AQ96MK3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FAM20AQ96MK3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
FAM20AQ96MK3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FAM20AQ96MK3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
FAM20AQ96MK3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FAM20AQ96MK3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FAM20AQ96MK3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM20AQ96MK3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM20AQ96MK3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM20AQ96MK3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM20AQ96MK3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM20AQ96MK3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAM20AQ96MK3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAM20AQ96MK3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAM20AQ96MK3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAM20AQ96MK3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAM20AQ96MK3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAM20AQ96MK3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
FAM20AQ96MK3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAM20AQ96MK3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAM20AQ96MK3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAM20AQ96MK3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAM20AQ96MK3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FAM20AQ96MK3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FAM20AQ96MK3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FAM20AQ96MK3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FAM20AQ96MK3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FAM20AQ96MK3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FAM20AQ96MK3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FAM20AQ96MK3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FAM20AQ96MK3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FAM20AQ96MK3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FAM20AQ96MK3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FAM20AQ96MK3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FAM20AQ96MK3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FAM20AQ96MK3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
FAM20AQ96MK3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
FAM20AQ96MK3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FAM20AQ96MK3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FAM20AQ96MK3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FAM20AQ96MK3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FAM20AQ96MK3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FAM20AQ96MK3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FAM20AQ96MK3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FAM20AQ96MK3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FAM20AQ96MK3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FAM20AQ96MK3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FAM20AQ96MK3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FAM20AQ96MK3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FAM20AQ96MK3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FAM20AQ96MK3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
FAM20AQ96MK3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FAM20AQ96MK3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FAM20AQ96MK3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FAM20AQ96MK3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
FAM20AQ96MK3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAM20AQ96MK3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAM20AQ96MK3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAM20AQ96MK3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAM20AQ96MK3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAM20AQ96MK3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAM20AQ96MK3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAM20AQ96MK3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAM20AQ96MK3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAM20AQ96MK3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAM20AQ96MK3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAM20AQ96MK3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAM20AQ96MK3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAM20AQ96MK3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAM20AQ96MK3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAM20AQ96MK3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAM20AQ96MK3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM20AQ96MK3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM20AQ96MK3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM20AQ96MK3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM20AQ96MK3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM20AQ96MK3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM20AQ96MK3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM20AQ96MK3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM20AQ96MK3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM20AQ96MK3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM20AQ96MK3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM20AQ96MK3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM20AQ96MK3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM20AQ96MK3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM20AQ96MK3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms