Protein–RNA interactions for Protein: Q96FN4

CPNE2, Copine-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE2Q96FN4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CPNE2Q96FN4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CPNE2Q96FN4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CPNE2Q96FN4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CPNE2Q96FN4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CPNE2Q96FN4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CPNE2Q96FN4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CPNE2Q96FN4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CPNE2Q96FN4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CPNE2Q96FN4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CPNE2Q96FN4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CPNE2Q96FN4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CPNE2Q96FN4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CPNE2Q96FN4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CPNE2Q96FN4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CPNE2Q96FN4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CPNE2Q96FN4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CPNE2Q96FN4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CPNE2Q96FN4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CPNE2Q96FN4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CPNE2Q96FN4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CPNE2Q96FN4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CPNE2Q96FN4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CPNE2Q96FN4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CPNE2Q96FN4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CPNE2Q96FN4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CPNE2Q96FN4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CPNE2Q96FN4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CPNE2Q96FN4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CPNE2Q96FN4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CPNE2Q96FN4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CPNE2Q96FN4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CPNE2Q96FN4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CPNE2Q96FN4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CPNE2Q96FN4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CPNE2Q96FN4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CPNE2Q96FN4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CPNE2Q96FN4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CPNE2Q96FN4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CPNE2Q96FN4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CPNE2Q96FN4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CPNE2Q96FN4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CPNE2Q96FN4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CPNE2Q96FN4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CPNE2Q96FN4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CPNE2Q96FN4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CPNE2Q96FN4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CPNE2Q96FN4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CPNE2Q96FN4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CPNE2Q96FN4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CPNE2Q96FN4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CPNE2Q96FN4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CPNE2Q96FN4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CPNE2Q96FN4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CPNE2Q96FN4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CPNE2Q96FN4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CPNE2Q96FN4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CPNE2Q96FN4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CPNE2Q96FN4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CPNE2Q96FN4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CPNE2Q96FN4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CPNE2Q96FN4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CPNE2Q96FN4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CPNE2Q96FN4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CPNE2Q96FN4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CPNE2Q96FN4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CPNE2Q96FN4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CPNE2Q96FN4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CPNE2Q96FN4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CPNE2Q96FN4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CPNE2Q96FN4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CPNE2Q96FN4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CPNE2Q96FN4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CPNE2Q96FN4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CPNE2Q96FN4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CPNE2Q96FN4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CPNE2Q96FN4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CPNE2Q96FN4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CPNE2Q96FN4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CPNE2Q96FN4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CPNE2Q96FN4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CPNE2Q96FN4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CPNE2Q96FN4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CPNE2Q96FN4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CPNE2Q96FN4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CPNE2Q96FN4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CPNE2Q96FN4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CPNE2Q96FN4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CPNE2Q96FN4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CPNE2Q96FN4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CPNE2Q96FN4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CPNE2Q96FN4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CPNE2Q96FN4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CPNE2Q96FN4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CPNE2Q96FN4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CPNE2Q96FN4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CPNE2Q96FN4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CPNE2Q96FN4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CPNE2Q96FN4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CPNE2Q96FN4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms