Protein–RNA interactions for Protein: Q96FC9

DDX11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX11Q96FC9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX11Q96FC9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX11Q96FC9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX11Q96FC9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX11Q96FC9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX11Q96FC9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX11Q96FC9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
DDX11Q96FC9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDX11Q96FC9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDX11Q96FC9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDX11Q96FC9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDX11Q96FC9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDX11Q96FC9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
DDX11Q96FC9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDX11Q96FC9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDX11Q96FC9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDX11Q96FC9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
DDX11Q96FC9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDX11Q96FC9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDX11Q96FC9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX11Q96FC9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX11Q96FC9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX11Q96FC9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX11Q96FC9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX11Q96FC9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX11Q96FC9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX11Q96FC9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX11Q96FC9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDX11Q96FC9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDX11Q96FC9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDX11Q96FC9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDX11Q96FC9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDX11Q96FC9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
DDX11Q96FC9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
DDX11Q96FC9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DDX11Q96FC9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DDX11Q96FC9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DDX11Q96FC9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DDX11Q96FC9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DDX11Q96FC9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDX11Q96FC9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDX11Q96FC9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDX11Q96FC9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDX11Q96FC9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
DDX11Q96FC9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDX11Q96FC9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDX11Q96FC9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX11Q96FC9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX11Q96FC9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX11Q96FC9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX11Q96FC9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX11Q96FC9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX11Q96FC9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX11Q96FC9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX11Q96FC9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDX11Q96FC9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDX11Q96FC9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
DDX11Q96FC9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDX11Q96FC9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDX11Q96FC9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDX11Q96FC9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDX11Q96FC9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDX11Q96FC9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDX11Q96FC9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDX11Q96FC9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
DDX11Q96FC9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDX11Q96FC9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDX11Q96FC9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDX11Q96FC9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDX11Q96FC9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDX11Q96FC9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDX11Q96FC9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDX11Q96FC9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDX11Q96FC9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDX11Q96FC9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDX11Q96FC9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DDX11Q96FC9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DDX11Q96FC9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DDX11Q96FC9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DDX11Q96FC9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DDX11Q96FC9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DDX11Q96FC9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DDX11Q96FC9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DDX11Q96FC9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DDX11Q96FC9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
DDX11Q96FC9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX11Q96FC9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX11Q96FC9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX11Q96FC9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX11Q96FC9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX11Q96FC9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX11Q96FC9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX11Q96FC9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX11Q96FC9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX11Q96FC9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX11Q96FC9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX11Q96FC9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX11Q96FC9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX11Q96FC9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX11Q96FC9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms