Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EDC3Q96F86 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
EDC3Q96F86 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EDC3Q96F86 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EDC3Q96F86 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EDC3Q96F86 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EDC3Q96F86 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
EDC3Q96F86 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EDC3Q96F86 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EDC3Q96F86 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EDC3Q96F86 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EDC3Q96F86 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EDC3Q96F86 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EDC3Q96F86 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EDC3Q96F86 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EDC3Q96F86 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EDC3Q96F86 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EDC3Q96F86 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EDC3Q96F86 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EDC3Q96F86 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EDC3Q96F86 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EDC3Q96F86 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EDC3Q96F86 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EDC3Q96F86 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EDC3Q96F86 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EDC3Q96F86 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EDC3Q96F86 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
EDC3Q96F86 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EDC3Q96F86 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EDC3Q96F86 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
EDC3Q96F86 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EDC3Q96F86 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EDC3Q96F86 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
EDC3Q96F86 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EDC3Q96F86 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EDC3Q96F86 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EDC3Q96F86 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EDC3Q96F86 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EDC3Q96F86 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
EDC3Q96F86 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
EDC3Q96F86 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
EDC3Q96F86 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
EDC3Q96F86 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
EDC3Q96F86 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
EDC3Q96F86 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
EDC3Q96F86 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
EDC3Q96F86 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EDC3Q96F86 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EDC3Q96F86 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
EDC3Q96F86 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EDC3Q96F86 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
EDC3Q96F86 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EDC3Q96F86 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
EDC3Q96F86 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EDC3Q96F86 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EDC3Q96F86 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
EDC3Q96F86 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EDC3Q96F86 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EDC3Q96F86 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EDC3Q96F86 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
EDC3Q96F86 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EDC3Q96F86 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EDC3Q96F86 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EDC3Q96F86 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
EDC3Q96F86 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
EDC3Q96F86 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
EDC3Q96F86 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EDC3Q96F86 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EDC3Q96F86 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
EDC3Q96F86 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EDC3Q96F86 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EDC3Q96F86 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EDC3Q96F86 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EDC3Q96F86 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EDC3Q96F86 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EDC3Q96F86 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EDC3Q96F86 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EDC3Q96F86 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EDC3Q96F86 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EDC3Q96F86 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EDC3Q96F86 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
EDC3Q96F86 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EDC3Q96F86 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EDC3Q96F86 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EDC3Q96F86 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EDC3Q96F86 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EDC3Q96F86 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EDC3Q96F86 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EDC3Q96F86 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EDC3Q96F86 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EDC3Q96F86 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
EDC3Q96F86 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EDC3Q96F86 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
EDC3Q96F86 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EDC3Q96F86 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
EDC3Q96F86 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EDC3Q96F86 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EDC3Q96F86 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EDC3Q96F86 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
EDC3Q96F86 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms