Protein–RNA interactions for Protein: Q96EU6

RRP36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP36Q96EU6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRP36Q96EU6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RRP36Q96EU6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRP36Q96EU6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRP36Q96EU6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RRP36Q96EU6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RRP36Q96EU6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
RRP36Q96EU6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RRP36Q96EU6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
RRP36Q96EU6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RRP36Q96EU6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RRP36Q96EU6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RRP36Q96EU6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RRP36Q96EU6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RRP36Q96EU6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RRP36Q96EU6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RRP36Q96EU6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RRP36Q96EU6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RRP36Q96EU6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRP36Q96EU6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRP36Q96EU6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRP36Q96EU6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RRP36Q96EU6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRP36Q96EU6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRP36Q96EU6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRP36Q96EU6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRP36Q96EU6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRP36Q96EU6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRP36Q96EU6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRP36Q96EU6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRP36Q96EU6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRP36Q96EU6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RRP36Q96EU6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRP36Q96EU6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRP36Q96EU6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRP36Q96EU6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRP36Q96EU6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRP36Q96EU6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRP36Q96EU6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRP36Q96EU6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRP36Q96EU6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRP36Q96EU6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RRP36Q96EU6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RRP36Q96EU6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RRP36Q96EU6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RRP36Q96EU6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RRP36Q96EU6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RRP36Q96EU6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RRP36Q96EU6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RRP36Q96EU6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RRP36Q96EU6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RRP36Q96EU6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRP36Q96EU6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRP36Q96EU6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRP36Q96EU6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRP36Q96EU6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRP36Q96EU6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRP36Q96EU6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRP36Q96EU6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRP36Q96EU6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRP36Q96EU6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRP36Q96EU6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRP36Q96EU6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRP36Q96EU6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRP36Q96EU6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRP36Q96EU6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRP36Q96EU6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RRP36Q96EU6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RRP36Q96EU6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRP36Q96EU6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRP36Q96EU6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRP36Q96EU6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRP36Q96EU6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRP36Q96EU6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRP36Q96EU6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRP36Q96EU6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRP36Q96EU6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRP36Q96EU6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRP36Q96EU6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRP36Q96EU6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRP36Q96EU6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRP36Q96EU6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRP36Q96EU6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRP36Q96EU6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRP36Q96EU6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRP36Q96EU6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRP36Q96EU6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRP36Q96EU6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RRP36Q96EU6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRP36Q96EU6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRP36Q96EU6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRP36Q96EU6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRP36Q96EU6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRP36Q96EU6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRP36Q96EU6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRP36Q96EU6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRP36Q96EU6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RRP36Q96EU6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRP36Q96EU6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRP36Q96EU6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms