Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC10A4Q96EP9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC10A4Q96EP9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC10A4Q96EP9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC10A4Q96EP9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC10A4Q96EP9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC10A4Q96EP9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC10A4Q96EP9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC10A4Q96EP9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC10A4Q96EP9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC10A4Q96EP9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC10A4Q96EP9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC10A4Q96EP9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC10A4Q96EP9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC10A4Q96EP9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC10A4Q96EP9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC10A4Q96EP9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC10A4Q96EP9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC10A4Q96EP9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC10A4Q96EP9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC10A4Q96EP9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC10A4Q96EP9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC10A4Q96EP9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC10A4Q96EP9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC10A4Q96EP9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC10A4Q96EP9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC10A4Q96EP9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC10A4Q96EP9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC10A4Q96EP9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC10A4Q96EP9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC10A4Q96EP9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC10A4Q96EP9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC10A4Q96EP9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC10A4Q96EP9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC10A4Q96EP9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC10A4Q96EP9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC10A4Q96EP9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC10A4Q96EP9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC10A4Q96EP9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC10A4Q96EP9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC10A4Q96EP9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC10A4Q96EP9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC10A4Q96EP9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC10A4Q96EP9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC10A4Q96EP9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC10A4Q96EP9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC10A4Q96EP9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC10A4Q96EP9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC10A4Q96EP9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC10A4Q96EP9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC10A4Q96EP9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC10A4Q96EP9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC10A4Q96EP9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC10A4Q96EP9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC10A4Q96EP9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC10A4Q96EP9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC10A4Q96EP9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC10A4Q96EP9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC10A4Q96EP9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC10A4Q96EP9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC10A4Q96EP9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC10A4Q96EP9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC10A4Q96EP9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC10A4Q96EP9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC10A4Q96EP9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC10A4Q96EP9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC10A4Q96EP9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC10A4Q96EP9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC10A4Q96EP9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC10A4Q96EP9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SLC10A4Q96EP9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SLC10A4Q96EP9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SLC10A4Q96EP9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC10A4Q96EP9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC10A4Q96EP9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC10A4Q96EP9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC10A4Q96EP9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC10A4Q96EP9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC10A4Q96EP9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC10A4Q96EP9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC10A4Q96EP9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC10A4Q96EP9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC10A4Q96EP9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC10A4Q96EP9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC10A4Q96EP9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC10A4Q96EP9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC10A4Q96EP9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC10A4Q96EP9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC10A4Q96EP9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC10A4Q96EP9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC10A4Q96EP9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC10A4Q96EP9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC10A4Q96EP9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC10A4Q96EP9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC10A4Q96EP9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC10A4Q96EP9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC10A4Q96EP9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC10A4Q96EP9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC10A4Q96EP9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC10A4Q96EP9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms