Protein–RNA interactions for Protein: Q96EK2

PHF21B, PHD finger protein 21B, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF21BQ96EK2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF21BQ96EK2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF21BQ96EK2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF21BQ96EK2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF21BQ96EK2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF21BQ96EK2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF21BQ96EK2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF21BQ96EK2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF21BQ96EK2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF21BQ96EK2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF21BQ96EK2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF21BQ96EK2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF21BQ96EK2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF21BQ96EK2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF21BQ96EK2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF21BQ96EK2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF21BQ96EK2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF21BQ96EK2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF21BQ96EK2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF21BQ96EK2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF21BQ96EK2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF21BQ96EK2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF21BQ96EK2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF21BQ96EK2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF21BQ96EK2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF21BQ96EK2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF21BQ96EK2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF21BQ96EK2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF21BQ96EK2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF21BQ96EK2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF21BQ96EK2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF21BQ96EK2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF21BQ96EK2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF21BQ96EK2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF21BQ96EK2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF21BQ96EK2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF21BQ96EK2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF21BQ96EK2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF21BQ96EK2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF21BQ96EK2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF21BQ96EK2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF21BQ96EK2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF21BQ96EK2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF21BQ96EK2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF21BQ96EK2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF21BQ96EK2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF21BQ96EK2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF21BQ96EK2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF21BQ96EK2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF21BQ96EK2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF21BQ96EK2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF21BQ96EK2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF21BQ96EK2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF21BQ96EK2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF21BQ96EK2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF21BQ96EK2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF21BQ96EK2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF21BQ96EK2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF21BQ96EK2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF21BQ96EK2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF21BQ96EK2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF21BQ96EK2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF21BQ96EK2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF21BQ96EK2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF21BQ96EK2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF21BQ96EK2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF21BQ96EK2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF21BQ96EK2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF21BQ96EK2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF21BQ96EK2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF21BQ96EK2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF21BQ96EK2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF21BQ96EK2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF21BQ96EK2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF21BQ96EK2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF21BQ96EK2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF21BQ96EK2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF21BQ96EK2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF21BQ96EK2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF21BQ96EK2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF21BQ96EK2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF21BQ96EK2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF21BQ96EK2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF21BQ96EK2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF21BQ96EK2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF21BQ96EK2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF21BQ96EK2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF21BQ96EK2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF21BQ96EK2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF21BQ96EK2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF21BQ96EK2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF21BQ96EK2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PHF21BQ96EK2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF21BQ96EK2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF21BQ96EK2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF21BQ96EK2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF21BQ96EK2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF21BQ96EK2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF21BQ96EK2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF21BQ96EK2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms