Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PGBD4Q96DM1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PGBD4Q96DM1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PGBD4Q96DM1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PGBD4Q96DM1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PGBD4Q96DM1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PGBD4Q96DM1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PGBD4Q96DM1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PGBD4Q96DM1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PGBD4Q96DM1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PGBD4Q96DM1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PGBD4Q96DM1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PGBD4Q96DM1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PGBD4Q96DM1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PGBD4Q96DM1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PGBD4Q96DM1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PGBD4Q96DM1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PGBD4Q96DM1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PGBD4Q96DM1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PGBD4Q96DM1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PGBD4Q96DM1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PGBD4Q96DM1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PGBD4Q96DM1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PGBD4Q96DM1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PGBD4Q96DM1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PGBD4Q96DM1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PGBD4Q96DM1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PGBD4Q96DM1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PGBD4Q96DM1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PGBD4Q96DM1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PGBD4Q96DM1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PGBD4Q96DM1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PGBD4Q96DM1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PGBD4Q96DM1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PGBD4Q96DM1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PGBD4Q96DM1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PGBD4Q96DM1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PGBD4Q96DM1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PGBD4Q96DM1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PGBD4Q96DM1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PGBD4Q96DM1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PGBD4Q96DM1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PGBD4Q96DM1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PGBD4Q96DM1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PGBD4Q96DM1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PGBD4Q96DM1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PGBD4Q96DM1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PGBD4Q96DM1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PGBD4Q96DM1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PGBD4Q96DM1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PGBD4Q96DM1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PGBD4Q96DM1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PGBD4Q96DM1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PGBD4Q96DM1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PGBD4Q96DM1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PGBD4Q96DM1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PGBD4Q96DM1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PGBD4Q96DM1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PGBD4Q96DM1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PGBD4Q96DM1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PGBD4Q96DM1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PGBD4Q96DM1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PGBD4Q96DM1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PGBD4Q96DM1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PGBD4Q96DM1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PGBD4Q96DM1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PGBD4Q96DM1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PGBD4Q96DM1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PGBD4Q96DM1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PGBD4Q96DM1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PGBD4Q96DM1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PGBD4Q96DM1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PGBD4Q96DM1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PGBD4Q96DM1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PGBD4Q96DM1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PGBD4Q96DM1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PGBD4Q96DM1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PGBD4Q96DM1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PGBD4Q96DM1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PGBD4Q96DM1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PGBD4Q96DM1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PGBD4Q96DM1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PGBD4Q96DM1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PGBD4Q96DM1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PGBD4Q96DM1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PGBD4Q96DM1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PGBD4Q96DM1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PGBD4Q96DM1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PGBD4Q96DM1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PGBD4Q96DM1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PGBD4Q96DM1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PGBD4Q96DM1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PGBD4Q96DM1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PGBD4Q96DM1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PGBD4Q96DM1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PGBD4Q96DM1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PGBD4Q96DM1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PGBD4Q96DM1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PGBD4Q96DM1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PGBD4Q96DM1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms