Protein–RNA interactions for Protein: Q96DE9

CXorf40B, Protein CXorf40B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXorf40BQ96DE9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXorf40BQ96DE9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXorf40BQ96DE9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXorf40BQ96DE9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CXorf40BQ96DE9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXorf40BQ96DE9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXorf40BQ96DE9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CXorf40BQ96DE9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CXorf40BQ96DE9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXorf40BQ96DE9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXorf40BQ96DE9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXorf40BQ96DE9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXorf40BQ96DE9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXorf40BQ96DE9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXorf40BQ96DE9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXorf40BQ96DE9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXorf40BQ96DE9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXorf40BQ96DE9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXorf40BQ96DE9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXorf40BQ96DE9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXorf40BQ96DE9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXorf40BQ96DE9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXorf40BQ96DE9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXorf40BQ96DE9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXorf40BQ96DE9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXorf40BQ96DE9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXorf40BQ96DE9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXorf40BQ96DE9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXorf40BQ96DE9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXorf40BQ96DE9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXorf40BQ96DE9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CXorf40BQ96DE9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXorf40BQ96DE9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXorf40BQ96DE9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CXorf40BQ96DE9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXorf40BQ96DE9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXorf40BQ96DE9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CXorf40BQ96DE9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXorf40BQ96DE9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXorf40BQ96DE9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXorf40BQ96DE9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXorf40BQ96DE9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXorf40BQ96DE9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXorf40BQ96DE9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXorf40BQ96DE9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXorf40BQ96DE9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXorf40BQ96DE9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CXorf40BQ96DE9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CXorf40BQ96DE9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXorf40BQ96DE9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXorf40BQ96DE9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXorf40BQ96DE9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXorf40BQ96DE9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXorf40BQ96DE9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CXorf40BQ96DE9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXorf40BQ96DE9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXorf40BQ96DE9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXorf40BQ96DE9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXorf40BQ96DE9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXorf40BQ96DE9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CXorf40BQ96DE9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXorf40BQ96DE9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXorf40BQ96DE9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXorf40BQ96DE9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXorf40BQ96DE9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXorf40BQ96DE9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXorf40BQ96DE9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXorf40BQ96DE9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXorf40BQ96DE9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXorf40BQ96DE9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CXorf40BQ96DE9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXorf40BQ96DE9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CXorf40BQ96DE9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXorf40BQ96DE9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CXorf40BQ96DE9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXorf40BQ96DE9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXorf40BQ96DE9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXorf40BQ96DE9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXorf40BQ96DE9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXorf40BQ96DE9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXorf40BQ96DE9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CXorf40BQ96DE9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CXorf40BQ96DE9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXorf40BQ96DE9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXorf40BQ96DE9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXorf40BQ96DE9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXorf40BQ96DE9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXorf40BQ96DE9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXorf40BQ96DE9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXorf40BQ96DE9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CXorf40BQ96DE9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXorf40BQ96DE9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXorf40BQ96DE9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXorf40BQ96DE9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXorf40BQ96DE9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CXorf40BQ96DE9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CXorf40BQ96DE9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CXorf40BQ96DE9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CXorf40BQ96DE9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CXorf40BQ96DE9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms