Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTUB2Q96DC9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
OTUB2Q96DC9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTUB2Q96DC9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTUB2Q96DC9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTUB2Q96DC9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTUB2Q96DC9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTUB2Q96DC9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTUB2Q96DC9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTUB2Q96DC9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
OTUB2Q96DC9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTUB2Q96DC9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTUB2Q96DC9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTUB2Q96DC9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTUB2Q96DC9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
OTUB2Q96DC9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTUB2Q96DC9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTUB2Q96DC9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTUB2Q96DC9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTUB2Q96DC9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTUB2Q96DC9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTUB2Q96DC9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTUB2Q96DC9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTUB2Q96DC9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTUB2Q96DC9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTUB2Q96DC9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTUB2Q96DC9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OTUB2Q96DC9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OTUB2Q96DC9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OTUB2Q96DC9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OTUB2Q96DC9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
OTUB2Q96DC9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
OTUB2Q96DC9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
OTUB2Q96DC9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
OTUB2Q96DC9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
OTUB2Q96DC9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
OTUB2Q96DC9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
OTUB2Q96DC9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
OTUB2Q96DC9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
OTUB2Q96DC9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
OTUB2Q96DC9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
OTUB2Q96DC9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
OTUB2Q96DC9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
OTUB2Q96DC9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
OTUB2Q96DC9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
OTUB2Q96DC9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
OTUB2Q96DC9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTUB2Q96DC9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTUB2Q96DC9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTUB2Q96DC9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTUB2Q96DC9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTUB2Q96DC9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTUB2Q96DC9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTUB2Q96DC9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
OTUB2Q96DC9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTUB2Q96DC9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTUB2Q96DC9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTUB2Q96DC9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
OTUB2Q96DC9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTUB2Q96DC9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTUB2Q96DC9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTUB2Q96DC9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTUB2Q96DC9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTUB2Q96DC9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTUB2Q96DC9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTUB2Q96DC9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OTUB2Q96DC9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
OTUB2Q96DC9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
OTUB2Q96DC9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OTUB2Q96DC9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OTUB2Q96DC9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
OTUB2Q96DC9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OTUB2Q96DC9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
OTUB2Q96DC9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
OTUB2Q96DC9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
OTUB2Q96DC9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
OTUB2Q96DC9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
OTUB2Q96DC9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
OTUB2Q96DC9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
OTUB2Q96DC9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
OTUB2Q96DC9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
OTUB2Q96DC9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
OTUB2Q96DC9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTUB2Q96DC9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTUB2Q96DC9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTUB2Q96DC9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTUB2Q96DC9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTUB2Q96DC9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTUB2Q96DC9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTUB2Q96DC9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
OTUB2Q96DC9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
OTUB2Q96DC9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
OTUB2Q96DC9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
OTUB2Q96DC9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
OTUB2Q96DC9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
OTUB2Q96DC9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTUB2Q96DC9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTUB2Q96DC9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTUB2Q96DC9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTUB2Q96DC9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms