Protein–RNA interactions for Protein: Q96CV9

OPTN, Optineurin, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTNQ96CV9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
OPTNQ96CV9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
OPTNQ96CV9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
OPTNQ96CV9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
OPTNQ96CV9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
OPTNQ96CV9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
OPTNQ96CV9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
OPTNQ96CV9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
OPTNQ96CV9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
OPTNQ96CV9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
OPTNQ96CV9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
OPTNQ96CV9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
OPTNQ96CV9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
OPTNQ96CV9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
OPTNQ96CV9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
OPTNQ96CV9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
OPTNQ96CV9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
OPTNQ96CV9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
OPTNQ96CV9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
OPTNQ96CV9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
OPTNQ96CV9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
OPTNQ96CV9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
OPTNQ96CV9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
OPTNQ96CV9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
OPTNQ96CV9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
OPTNQ96CV9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
OPTNQ96CV9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
OPTNQ96CV9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
OPTNQ96CV9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
OPTNQ96CV9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
OPTNQ96CV9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
OPTNQ96CV9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
OPTNQ96CV9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
OPTNQ96CV9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
OPTNQ96CV9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
OPTNQ96CV9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
OPTNQ96CV9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
OPTNQ96CV9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
OPTNQ96CV9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
OPTNQ96CV9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
OPTNQ96CV9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
OPTNQ96CV9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
OPTNQ96CV9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
OPTNQ96CV9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
OPTNQ96CV9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
OPTNQ96CV9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
OPTNQ96CV9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
OPTNQ96CV9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
OPTNQ96CV9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
OPTNQ96CV9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
OPTNQ96CV9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
OPTNQ96CV9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
OPTNQ96CV9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
OPTNQ96CV9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
OPTNQ96CV9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
OPTNQ96CV9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
OPTNQ96CV9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
OPTNQ96CV9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
OPTNQ96CV9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
OPTNQ96CV9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
OPTNQ96CV9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
OPTNQ96CV9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
OPTNQ96CV9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
OPTNQ96CV9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
OPTNQ96CV9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
OPTNQ96CV9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
OPTNQ96CV9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
OPTNQ96CV9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
OPTNQ96CV9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
OPTNQ96CV9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
OPTNQ96CV9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
OPTNQ96CV9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
OPTNQ96CV9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
OPTNQ96CV9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
OPTNQ96CV9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
OPTNQ96CV9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
OPTNQ96CV9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
OPTNQ96CV9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
OPTNQ96CV9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
OPTNQ96CV9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
OPTNQ96CV9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
OPTNQ96CV9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
OPTNQ96CV9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
OPTNQ96CV9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
OPTNQ96CV9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
OPTNQ96CV9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
OPTNQ96CV9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
OPTNQ96CV9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
OPTNQ96CV9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
OPTNQ96CV9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
OPTNQ96CV9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
OPTNQ96CV9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
OPTNQ96CV9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
OPTNQ96CV9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
OPTNQ96CV9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
OPTNQ96CV9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
OPTNQ96CV9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
OPTNQ96CV9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
OPTNQ96CV9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
OPTNQ96CV9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms