Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG8

CTHRC1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTHRC1Q96CG8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTHRC1Q96CG8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTHRC1Q96CG8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTHRC1Q96CG8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTHRC1Q96CG8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CTHRC1Q96CG8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTHRC1Q96CG8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTHRC1Q96CG8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CTHRC1Q96CG8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTHRC1Q96CG8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTHRC1Q96CG8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTHRC1Q96CG8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTHRC1Q96CG8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTHRC1Q96CG8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTHRC1Q96CG8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CTHRC1Q96CG8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CTHRC1Q96CG8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTHRC1Q96CG8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTHRC1Q96CG8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTHRC1Q96CG8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTHRC1Q96CG8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTHRC1Q96CG8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTHRC1Q96CG8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTHRC1Q96CG8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTHRC1Q96CG8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTHRC1Q96CG8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTHRC1Q96CG8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTHRC1Q96CG8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTHRC1Q96CG8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTHRC1Q96CG8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTHRC1Q96CG8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CTHRC1Q96CG8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTHRC1Q96CG8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CTHRC1Q96CG8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTHRC1Q96CG8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CTHRC1Q96CG8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTHRC1Q96CG8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CTHRC1Q96CG8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTHRC1Q96CG8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTHRC1Q96CG8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTHRC1Q96CG8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTHRC1Q96CG8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTHRC1Q96CG8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTHRC1Q96CG8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTHRC1Q96CG8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTHRC1Q96CG8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTHRC1Q96CG8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTHRC1Q96CG8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTHRC1Q96CG8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTHRC1Q96CG8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTHRC1Q96CG8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTHRC1Q96CG8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTHRC1Q96CG8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTHRC1Q96CG8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTHRC1Q96CG8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTHRC1Q96CG8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTHRC1Q96CG8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTHRC1Q96CG8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTHRC1Q96CG8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTHRC1Q96CG8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTHRC1Q96CG8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTHRC1Q96CG8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTHRC1Q96CG8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTHRC1Q96CG8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTHRC1Q96CG8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTHRC1Q96CG8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTHRC1Q96CG8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTHRC1Q96CG8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTHRC1Q96CG8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTHRC1Q96CG8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTHRC1Q96CG8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTHRC1Q96CG8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTHRC1Q96CG8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTHRC1Q96CG8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTHRC1Q96CG8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTHRC1Q96CG8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CTHRC1Q96CG8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTHRC1Q96CG8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTHRC1Q96CG8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTHRC1Q96CG8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTHRC1Q96CG8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTHRC1Q96CG8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTHRC1Q96CG8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTHRC1Q96CG8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTHRC1Q96CG8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTHRC1Q96CG8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTHRC1Q96CG8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTHRC1Q96CG8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTHRC1Q96CG8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTHRC1Q96CG8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTHRC1Q96CG8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTHRC1Q96CG8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTHRC1Q96CG8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CTHRC1Q96CG8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTHRC1Q96CG8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTHRC1Q96CG8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTHRC1Q96CG8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTHRC1Q96CG8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTHRC1Q96CG8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTHRC1Q96CG8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms