Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF18Q96CE8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF18Q96CE8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TM4SF18Q96CE8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM4SF18Q96CE8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM4SF18Q96CE8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM4SF18Q96CE8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM4SF18Q96CE8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM4SF18Q96CE8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM4SF18Q96CE8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TM4SF18Q96CE8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM4SF18Q96CE8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM4SF18Q96CE8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM4SF18Q96CE8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM4SF18Q96CE8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM4SF18Q96CE8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TM4SF18Q96CE8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TM4SF18Q96CE8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TM4SF18Q96CE8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TM4SF18Q96CE8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TM4SF18Q96CE8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TM4SF18Q96CE8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TM4SF18Q96CE8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TM4SF18Q96CE8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TM4SF18Q96CE8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TM4SF18Q96CE8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TM4SF18Q96CE8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TM4SF18Q96CE8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TM4SF18Q96CE8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TM4SF18Q96CE8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TM4SF18Q96CE8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TM4SF18Q96CE8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TM4SF18Q96CE8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TM4SF18Q96CE8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM4SF18Q96CE8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM4SF18Q96CE8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TM4SF18Q96CE8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM4SF18Q96CE8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM4SF18Q96CE8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM4SF18Q96CE8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM4SF18Q96CE8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TM4SF18Q96CE8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM4SF18Q96CE8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TM4SF18Q96CE8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF18Q96CE8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF18Q96CE8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF18Q96CE8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF18Q96CE8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF18Q96CE8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF18Q96CE8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF18Q96CE8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TM4SF18Q96CE8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM4SF18Q96CE8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM4SF18Q96CE8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM4SF18Q96CE8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM4SF18Q96CE8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM4SF18Q96CE8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM4SF18Q96CE8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM4SF18Q96CE8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM4SF18Q96CE8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM4SF18Q96CE8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM4SF18Q96CE8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM4SF18Q96CE8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TM4SF18Q96CE8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TM4SF18Q96CE8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TM4SF18Q96CE8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TM4SF18Q96CE8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TM4SF18Q96CE8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TM4SF18Q96CE8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TM4SF18Q96CE8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TM4SF18Q96CE8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM4SF18Q96CE8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM4SF18Q96CE8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM4SF18Q96CE8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM4SF18Q96CE8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM4SF18Q96CE8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM4SF18Q96CE8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM4SF18Q96CE8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM4SF18Q96CE8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TM4SF18Q96CE8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM4SF18Q96CE8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM4SF18Q96CE8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TM4SF18Q96CE8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TM4SF18Q96CE8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TM4SF18Q96CE8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TM4SF18Q96CE8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TM4SF18Q96CE8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TM4SF18Q96CE8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TM4SF18Q96CE8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TM4SF18Q96CE8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TM4SF18Q96CE8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM4SF18Q96CE8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM4SF18Q96CE8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM4SF18Q96CE8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM4SF18Q96CE8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM4SF18Q96CE8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM4SF18Q96CE8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM4SF18Q96CE8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM4SF18Q96CE8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TM4SF18Q96CE8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms