Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMIGD2Q96BF3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMIGD2Q96BF3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMIGD2Q96BF3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMIGD2Q96BF3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMIGD2Q96BF3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMIGD2Q96BF3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMIGD2Q96BF3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMIGD2Q96BF3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMIGD2Q96BF3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMIGD2Q96BF3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMIGD2Q96BF3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMIGD2Q96BF3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMIGD2Q96BF3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMIGD2Q96BF3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMIGD2Q96BF3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMIGD2Q96BF3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMIGD2Q96BF3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMIGD2Q96BF3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TMIGD2Q96BF3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMIGD2Q96BF3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMIGD2Q96BF3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMIGD2Q96BF3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMIGD2Q96BF3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMIGD2Q96BF3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMIGD2Q96BF3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMIGD2Q96BF3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMIGD2Q96BF3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMIGD2Q96BF3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMIGD2Q96BF3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMIGD2Q96BF3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMIGD2Q96BF3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMIGD2Q96BF3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMIGD2Q96BF3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TMIGD2Q96BF3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMIGD2Q96BF3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.33■■□□□ 1
TMIGD2Q96BF3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TMIGD2Q96BF3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMIGD2Q96BF3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMIGD2Q96BF3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMIGD2Q96BF3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMIGD2Q96BF3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMIGD2Q96BF3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMIGD2Q96BF3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMIGD2Q96BF3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMIGD2Q96BF3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMIGD2Q96BF3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMIGD2Q96BF3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMIGD2Q96BF3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMIGD2Q96BF3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMIGD2Q96BF3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMIGD2Q96BF3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMIGD2Q96BF3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
TMIGD2Q96BF3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMIGD2Q96BF3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMIGD2Q96BF3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMIGD2Q96BF3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMIGD2Q96BF3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMIGD2Q96BF3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TMIGD2Q96BF3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMIGD2Q96BF3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMIGD2Q96BF3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMIGD2Q96BF3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMIGD2Q96BF3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMIGD2Q96BF3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMIGD2Q96BF3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMIGD2Q96BF3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMIGD2Q96BF3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMIGD2Q96BF3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMIGD2Q96BF3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMIGD2Q96BF3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMIGD2Q96BF3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMIGD2Q96BF3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMIGD2Q96BF3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMIGD2Q96BF3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TMIGD2Q96BF3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TMIGD2Q96BF3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TMIGD2Q96BF3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMIGD2Q96BF3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMIGD2Q96BF3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMIGD2Q96BF3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMIGD2Q96BF3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMIGD2Q96BF3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMIGD2Q96BF3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMIGD2Q96BF3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMIGD2Q96BF3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMIGD2Q96BF3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMIGD2Q96BF3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMIGD2Q96BF3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMIGD2Q96BF3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMIGD2Q96BF3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMIGD2Q96BF3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMIGD2Q96BF3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMIGD2Q96BF3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMIGD2Q96BF3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMIGD2Q96BF3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TMIGD2Q96BF3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TMIGD2Q96BF3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TMIGD2Q96BF3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TMIGD2Q96BF3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms