Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.453e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 TTC7B-207ENST00000555239 591 ntTSL 35.96□□□□□ -1.463e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 TMEM45B-205ENST00000529381 515 ntTSL 25.95□□□□□ -1.463e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 TBC1D5-217ENST00000444756 545 ntTSL 45.88□□□□□ -1.473e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 TBC1D5-214ENST00000443386 561 ntTSL 45.88□□□□□ -1.473e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 ATP2B4-207ENST00000484746 4697 ntTSL 1 (best)5.87□□□□□ -1.473e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 TBC1D5-228ENST00000486224 526 ntTSL 35.7□□□□□ -1.53e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 SBF2-210ENST00000530741 993 ntTSL 55.62□□□□□ -1.513e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.513e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 NF1-216ENST00000495910 8223 ntTSL 25.61□□□□□ -1.513e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 NF1-219ENST00000579081 8788 ntTSL 1 (best)5.58□□□□□ -1.523e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.533e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 RFX2-212ENST00000589523 462 ntTSL 35.42□□□□□ -1.543e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 THRAP3-202ENST00000466743 537 ntTSL 25.28□□□□□ -1.563e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.593e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 CNOT6-204ENST00000504343 706 ntTSL 34.97□□□□□ -1.613e-9■■■■■ 78.5
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TBRG4Q969Z0 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.633e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.633e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 AC108488.1-203ENST00000416463 436 ntTSL 34.86□□□□□ -1.633e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.643e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.653e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 POT1-211ENST00000607932 1827 ntTSL 1 (best)4.72□□□□□ -1.653e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 TBC1D5-230ENST00000507877 578 ntTSL 44.6□□□□□ -1.673e-9■■■■■ 78.5
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TBRG4Q969Z0 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.723e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 CREM-246ENST00000496019 563 ntTSL 34.29□□□□□ -1.723e-9■■■■■ 78.5
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TBRG4Q969Z0 EPM2A-206ENST00000496228 560 ntTSL 44.2□□□□□ -1.743e-9■■■■■ 78.5
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TBRG4Q969Z0 DHX15-204ENST00000508032 3028 ntTSL 1 (best)3.89□□□□□ -1.793e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 DUSP16-206ENST00000545864 554 ntTSL 43.87□□□□□ -1.793e-9■■■■■ 78.5
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TBRG4Q969Z0 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.83e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.853e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 EPM2A-228ENST00000640898 322 ntTSL 43.27□□□□□ -1.893e-9■■■■■ 78.5
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TBRG4Q969Z0 WDR12-208ENST00000478869 541 ntTSL 21.83□□□□□ -2.123e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 TBC1D5-225ENST00000480435 560 ntTSL 51.37□□□□□ -2.193e-9■■■■■ 78.5
TBRG4Q969Z0 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.293e-9■■■■■ 78.5
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TBRG4Q969Z0 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.172e-11■■■■■ 76.5
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TBRG4Q969Z0 PCBP2-201ENST00000359282 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.392e-11■■■■■ 76.5
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TBRG4Q969Z0 AC023509.1-201ENST00000547717 1571 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.712e-11■■■■■ 76.5
TBRG4Q969Z0 PCBP2-203ENST00000437231 3026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.712e-11■■■■■ 76.5
TBRG4Q969Z0 PCBP2-210ENST00000547859 1919 ntTSL 210.48□□□□□ -0.732e-11■■■■■ 76.5
TBRG4Q969Z0 PCBP2-205ENST00000447282 3077 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.742e-11■■■■■ 76.5
TBRG4Q969Z0 PCBP2-223ENST00000552819 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.772e-11■■■■■ 76.5
TBRG4Q969Z0 PCBP2-206ENST00000455667 2741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.892e-11■■■■■ 76.5
TBRG4Q969Z0 PCBP2-207ENST00000546463 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.932e-11■■■■■ 76.5
TBRG4Q969Z0 PCBP2-218ENST00000550585 2543 ntTSL 59.01□□□□□ -0.972e-11■■■■■ 76.5
TBRG4Q969Z0 PCBP2-213ENST00000548933 1202 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.982e-11■■■■■ 76.5
TBRG4Q969Z0 PCBP2-211ENST00000547987 681 ntTSL 38.78□□□□□ -12e-11■■■■■ 76.5
TBRG4Q969Z0 PCBP2-222ENST00000552296 1342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.042e-11■■■■■ 76.5
TBRG4Q969Z0 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.325e-9■■■■■ 76.5
TBRG4Q969Z0 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.615e-9■■■■■ 76.5
TBRG4Q969Z0 PCBP2-214ENST00000549272 445 ntTSL 22.67□□□□□ -1.982e-11■■■■■ 76.5
TBRG4Q969Z0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.21e-7■■■■■ 75.8
TBRG4Q969Z0 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.931e-7■■■■■ 75.8
TBRG4Q969Z0 DNAH14-217ENST00000495456 478 ntTSL 36.05□□□□□ -1.446e-7■■■■■ 75.8
TBRG4Q969Z0 DNAH14-202ENST00000328556 612 ntTSL 32.86□□□□□ -1.956e-7■■■■■ 75.8
TBRG4Q969Z0 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.621e-9■■■■■ 75.7
TBRG4Q969Z0 PAH-212ENST00000551337 675 ntTSL 318.08■□□□□ 0.481e-9■■■■■ 75.7
TBRG4Q969Z0 LGALS9-206ENST00000481514 2349 ntTSL 1 (best)15.89■□□□□ 0.131e-9■■■■■ 75.7
TBRG4Q969Z0 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.211e-9■■■■■ 75.7
TBRG4Q969Z0 LGALS9-207ENST00000486774 2951 ntTSL 213.51□□□□□ -0.251e-9■■■■■ 75.7
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