RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572588.1

MKL2-206, Transcript of MKL/myocardin-like protein 2, human

TSL 1 (best)

Gene MKL2, Length 7,897 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MKL2-206	ENST00000572588	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		6.28	□□□□□ -1.4
MKL2-206	ENST00000572588	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		5.72	□□□□□ -1.49
MKL2-206	ENST00000572588	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		5.48	□□□□□ -1.53
MKL2-206	ENST00000572588	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		5.47	□□□□□ -1.53
MKL2-206	ENST00000572588	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
MKL2-206	ENST00000572588	ABCC9	O60706	1549 aa		5.24	□□□□□ -1.57
MKL2-206	ENST00000572588	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MKL2-206	ENST00000572588	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		5.21	□□□□□ -1.58
MKL2-206	ENST00000572588	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		5.21	□□□□□ -1.58
MKL2-206	ENST00000572588	SLC24A1	O60721	1099 aa		5.16	□□□□□ -1.58
MKL2-206	ENST00000572588	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	5.15	□□□□□ -1.58
MKL2-206	ENST00000572588	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		5.14	□□□□□ -1.59
MKL2-206	ENST00000572588	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		5.13	□□□□□ -1.59
MKL2-206	ENST00000572588	NACAD	O15069	1562 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MKL2-206	ENST00000572588	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MKL2-206	ENST00000572588	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MKL2-206	ENST00000572588	MYT1	Q01538	1121 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MKL2-206	ENST00000572588	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MKL2-206	ENST00000572588	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	5.01	□□□□□ -1.61
MKL2-206	ENST00000572588	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		5	□□□□□ -1.61
MKL2-206	ENST00000572588	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MKL2-206	ENST00000572588	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MKL2-206	ENST00000572588	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MKL2-206	ENST00000572588	SCRIB	Q14160	1630 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MKL2-206	ENST00000572588	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MKL2-206	ENST00000572588	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MKL2-206	ENST00000572588	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MKL2-206	ENST00000572588	NCAPD3	P42695	1498 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MKL2-206	ENST00000572588	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MKL2-206	ENST00000572588	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MKL2-206	ENST00000572588	KCNA4	P22459	653 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MKL2-206	ENST00000572588	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MKL2-206	ENST00000572588	TRIM41	Q8WV44	630 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MKL2-206	ENST00000572588	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MKL2-206	ENST00000572588	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MKL2-206	ENST00000572588	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MKL2-206	ENST00000572588	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MKL2-206	ENST00000572588	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MKL2-206	ENST00000572588	ARID3A	Q99856	593 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MKL2-206	ENST00000572588	SMARCA2	P51531	1590 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MKL2-206	ENST00000572588	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
MKL2-206	ENST00000572588	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MKL2-206	ENST00000572588	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MKL2-206	ENST00000572588	CFAP44	Q96MT7	982 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MKL2-206	ENST00000572588	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
MKL2-206	ENST00000572588	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MKL2-206	ENST00000572588	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MKL2-206	ENST00000572588	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	4.7	□□□□□ -1.66
MKL2-206	ENST00000572588	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MKL2-206	ENST00000572588	FKBP8	Q14318	412 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MKL2-206	ENST00000572588	EEA1	Q15075	1411 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MKL2-206	ENST00000572588	HMGXB3	Q12766	1538 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MKL2-206	ENST00000572588	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MKL2-206	ENST00000572588	CFTR	P13569	1480 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MKL2-206	ENST00000572588	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
MKL2-206	ENST00000572588	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MKL2-206	ENST00000572588	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MKL2-206	ENST00000572588	C14orf37	Q86TY3	774 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MKL2-206	ENST00000572588	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
MKL2-206	ENST00000572588	NBR1	Q14596	966 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MKL2-206	ENST00000572588	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
MKL2-206	ENST00000572588	SMARCA4	P51532	1647 aa		4.65	□□□□□ -1.66
MKL2-206	ENST00000572588	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
MKL2-206	ENST00000572588	KLHL34	Q8N239	644 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MKL2-206	ENST00000572588	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MKL2-206	ENST00000572588	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MKL2-206	ENST00000572588	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MKL2-206	ENST00000572588	ADRA2B	P18089	450 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MKL2-206	ENST00000572588	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MKL2-206	ENST00000572588	KIF27	Q86VH2	1401 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MKL2-206	ENST00000572588	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
MKL2-206	ENST00000572588	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MKL2-206	ENST00000572588	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MKL2-206	ENST00000572588	BCAN	Q96GW7	911 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MKL2-206	ENST00000572588	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MKL2-206	ENST00000572588	IGF1R	P08069	1367 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MKL2-206	ENST00000572588	ABCC8	Q09428	1581 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MKL2-206	ENST00000572588	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MKL2-206	ENST00000572588	SOGA1	O94964	1423 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MKL2-206	ENST00000572588	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MKL2-206	ENST00000572588	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MKL2-206	ENST00000572588	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MKL2-206	ENST00000572588	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MKL2-206	ENST00000572588	CUX2	O14529	1486 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MKL2-206	ENST00000572588	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MKL2-206	ENST00000572588	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MKL2-206	ENST00000572588	WIZ	O95785	1651 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MKL2-206	ENST00000572588	APLP2	Q06481	763 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MKL2-206	ENST00000572588	GOLGA3	Q08378	1498 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MKL2-206	ENST00000572588	ARX	Q96QS3	562 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MKL2-206	ENST00000572588	PRX	Q9BXM0	1461 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MKL2-206	ENST00000572588	NES	P48681	1621 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MKL2-206	ENST00000572588	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MKL2-206	ENST00000572588	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MKL2-206	ENST00000572588	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
MKL2-206	ENST00000572588	IFT140	Q96RY7	1462 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MKL2-206	ENST00000572588	PIAS4	Q8N2W9	510 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
MKL2-206	ENST00000572588	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MKL2-206	ENST00000572588	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		4.5	□□□□□ -1.69
MKL2-206	ENST00000572588	ERCC6	Q03468	1493 aa		4.5	□□□□□ -1.69

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