Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPTSSAQ969W0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPTSSAQ969W0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPTSSAQ969W0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPTSSAQ969W0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SPTSSAQ969W0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPTSSAQ969W0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPTSSAQ969W0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPTSSAQ969W0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPTSSAQ969W0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPTSSAQ969W0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPTSSAQ969W0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPTSSAQ969W0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPTSSAQ969W0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPTSSAQ969W0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPTSSAQ969W0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPTSSAQ969W0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SPTSSAQ969W0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPTSSAQ969W0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPTSSAQ969W0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPTSSAQ969W0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPTSSAQ969W0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPTSSAQ969W0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPTSSAQ969W0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPTSSAQ969W0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPTSSAQ969W0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPTSSAQ969W0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPTSSAQ969W0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SPTSSAQ969W0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPTSSAQ969W0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPTSSAQ969W0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPTSSAQ969W0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SPTSSAQ969W0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPTSSAQ969W0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPTSSAQ969W0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPTSSAQ969W0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPTSSAQ969W0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPTSSAQ969W0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPTSSAQ969W0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPTSSAQ969W0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPTSSAQ969W0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPTSSAQ969W0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPTSSAQ969W0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPTSSAQ969W0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPTSSAQ969W0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPTSSAQ969W0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPTSSAQ969W0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPTSSAQ969W0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SPTSSAQ969W0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPTSSAQ969W0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPTSSAQ969W0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPTSSAQ969W0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPTSSAQ969W0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SPTSSAQ969W0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPTSSAQ969W0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPTSSAQ969W0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPTSSAQ969W0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPTSSAQ969W0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPTSSAQ969W0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPTSSAQ969W0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPTSSAQ969W0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPTSSAQ969W0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPTSSAQ969W0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPTSSAQ969W0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPTSSAQ969W0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPTSSAQ969W0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPTSSAQ969W0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPTSSAQ969W0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPTSSAQ969W0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPTSSAQ969W0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPTSSAQ969W0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPTSSAQ969W0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPTSSAQ969W0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPTSSAQ969W0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPTSSAQ969W0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPTSSAQ969W0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPTSSAQ969W0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SPTSSAQ969W0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPTSSAQ969W0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPTSSAQ969W0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPTSSAQ969W0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPTSSAQ969W0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPTSSAQ969W0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPTSSAQ969W0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPTSSAQ969W0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPTSSAQ969W0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPTSSAQ969W0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPTSSAQ969W0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPTSSAQ969W0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPTSSAQ969W0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPTSSAQ969W0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SPTSSAQ969W0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPTSSAQ969W0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPTSSAQ969W0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPTSSAQ969W0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPTSSAQ969W0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPTSSAQ969W0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPTSSAQ969W0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPTSSAQ969W0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPTSSAQ969W0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms